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read.3 161 pindel-ref 8505 60 54M1D46M = 8806 401 CAATTAAACGCGCCCCCATCTCCTTCATTTTTTCCCACTTGTCTTTCATGGCTTCCGGGCAAGCGTATTAGGATCAGCTTGAACAATACCTAGACCACCA * NM:i:1 MD:Z:54^C46 MC:Z:100M AS:i:93 XS:i:0
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read.184 99 pindel-ref 3699 60 100M = 3999 400 AAGTCGTTTTTGCAGGCTCTTCCAATTTGCGAACTTCAACAGGAATATCCAGAGCTTGGTAATCATTTTGGATTTTCGGGTAATCACCGTAAATAATTAC * NM:i:0 MD:Z:100 MC:Z:100M AS:i:100 XS:i:0
read.184 147 pindel-ref 3999 60 100M = 3699 -400 AATGTGCCTGCTGTCATTTTGTTGCTAGTAGCATGTTTTTTCCAGTTGGCACTTGAACCAAGTAAAGTAAGGTCAGGGTTTTCACCTTTTGATGTATCCC * NM:i:0 MD:Z:100 MC:Z:100M AS:i:100 XS:i:0
read.185 81 pindel-ref 6960 60 100M = 6658 -402 CTATTGTTTTCATATTGTATAAATTCTGATGTTTTAAAAAATATAACATAAGAAAAATTACAGACCCAACTTTTTAAAAGCTTTTTCATCCAACTTTCTC * NM:i:0 MD:Z:100 MC:Z:100M AS:i:100 XS:i:0
read.185 161 pindel-ref 6658 60 100M = 6960 402 ACTAAGATAATTTTGATCTAGAGCTTCTGCACCATCTAAAGATTTATACAGCTCTTTAGATTCCTCTAAATTGTCTTTTAAAAACGTGGTGAGGTTTAGT * NM:i:0 MD:Z:100 MC:Z:100M AS:i:100 XS:i:0
read.186 81 pindel-ref 9921 60 46M2I52M = 9621 -398 TAAGCGTTTATTTACATTGTCAGGGCCAAGCTGTCCTCTTGTAACACTTCGACAATGTAAGTAAAACCATCTGCACCAAGAGCTTCTCGCACACCTGCTG * NM:i:2 MD:Z:98 MC:Z:100M AS:i:90 XS:i:0
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read.395 161 pindel-ref 8319 60 100M = 8629 410 TGATTTCGAACATCAAATCATCTTTAGTTAGAACATCCACATTAGGCGTTACAAACTTAGCAGCCCATCGTAATGCTGCTGACAAGGCTTCATTCATATT * NM:i:0 MD:Z:100 MC:Z:100M AS:i:100 XS:i:0
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read.397 81 pindel-ref 10242 60 6M3D94M = 9944 -401 GTCTTCAATAGCTGAAAGACATAGATGCTCCCACACTTCACCGTTACCACCAGCTACAGGAACGCCGTCTTTTCTATCACCTAGCAACCATCCAGCTAAA * NM:i:3 MD:Z:6^CTG94 MC:Z:23M2I75M AS:i:94 XS:i:0
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read.496 97 pindel-ref 5795 60 46M2I52M = 6093 398 AAGCGCCCTTTAGGACGCTTCATTTCTATAAATGATTATTTACTTACCAAGCTTGGCGTACAAATGCATCTTTTGCTTCAAGTAGCTTTCTTAATCCTGT * NM:i:2 MD:Z:98 MC:Z:100M AS:i:90 XS:i:0
read.496 145 pindel-ref 6093 60 100M = 5795 -398 CTTTTAATCTTTCAAAAGTAAAACCATAAATTGCCATGGCTTGAAACCTTAATTTGAAGAAATGGCACCAGAATTCATTTTGTGCTCAGAATATATTGAG * NM:i:0 MD:Z:100 MC:Z:46M2I52M AS:i:100 XS:i:0
read.497 97 pindel-ref 7579 60 100M = 7879 406 TTAAGTCGTTTGGTACCACGAATACGCTGAACAATTTCTTGGTTAGTTTTGCCTGAATTAATACCATCTCGAATTGCATACTCAACCTTTTGACGGGCAC * NM:i:0 MD:Z:100 MC:Z:46M6D54M AS:i:100 XS:i:0
read.497 145 pindel-ref 7879 60 46M6D54M = 7579 -406 AACCATTGGGCAATCAAATCCCTAATTTCCCTTAAATTTGAAGTTGTACCACCAGCTAAAGCAACTTTCTCCGACTCATTAAGCTCATCCAATAAATCCC * NM:i:6 MD:Z:46^TATATT54 MC:Z:100M AS:i:88 XS:i:0
read.498 81 pindel-ref 2678 60 22M5D25M12D53M = 2378 -417 GCCACGACCAGAATAGTTTTCTTTCAACATGAGTTTCAGTCTTAGGATTTGATATCCGTTCACACGTAAAGGTATGAACGGCGTCCGCTAAATCTTCATT * NM:i:17 MD:Z:22^TTAAC25^TCCCAATTTGTT53 MC:Z:100M AS:i:71 XS:i:0
read.498 161 pindel-ref 2378 60 100M = 2678 417 TTTAAGTCTCTATTGTTATGTTGAAAGAGTAATAGATATAGTGACAAAAATAAGGATTTCAATAATATAACTGATAAAAGATATACTAAAAATTTAAACC * NM:i:0 MD:Z:100 MC:Z:22M5D25M12D53M AS:i:100 XS:i:0
read.499 81 pindel-ref 8764 60 100M = 8463 -401 ATTGAGATTAGCCAAAGGAAGTAATGGAGGCTTTTTAATCTCTTCTGAATTATCAATTGCACCTACAAATGTAAAAGGTATATAGGTCCAGAAATTCCCG * NM:i:0 MD:Z:100 MC:Z:100M AS:i:100 XS:i:0
read.499 161 pindel-ref 8463 60 100M = 8764 401 TATTCGCTTCGGTAGCGGTCTTTTTACTTCCCGAGCCCTTCTCAATTAAACGCGCCCCCATCTCCTTCATTTTTTCCCACTTGTCTTTCATGGCTTCCGG * NM:i:1 MD:Z:98C1 MC:Z:100M AS:i:98 XS:i:0