From cac26830d2afb62827698d2e2a84bfd3ce08acaa Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: arwa-ebi Date: Wed, 20 Sep 2023 16:25:37 +0100 Subject: [PATCH] Added parent classes for hematological terms --- src/ontology/efo-edit.owl | 9 ++++++++- 1 file changed, 8 insertions(+), 1 deletion(-) diff --git a/src/ontology/efo-edit.owl b/src/ontology/efo-edit.owl index 560694c0..607745bf 100644 --- a/src/ontology/efo-edit.owl +++ b/src/ontology/efo-edit.owl @@ -120818,6 +120818,7 @@ AnnotationAssertion(oboInOwl:hasExactSynonym efo:EFO_0004587 "lymphocyte counts" AnnotationAssertion(rdfs:label efo:EFO_0004587 "lymphocyte count") AnnotationAssertion(owl:incompatibleWith efo:EFO_0004587 "true") SubClassOf(efo:EFO_0004587 efo:EFO_0004308) +SubClassOf(efo:EFO_0004587 efo:EFO_0803546) SubClassOf(efo:EFO_0004587 ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:CL_0000081)) SubClassOf(efo:EFO_0004587 ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:CL_0000542)) SubClassOf(efo:EFO_0004587 ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 efo:EFO_0001378)) @@ -123189,6 +123190,7 @@ AnnotationAssertion(oboInOwl:hasDbXref efo:EFO_0004833 "SNOMEDCT:30630007") AnnotationAssertion(oboInOwl:hasExactSynonym efo:EFO_0004833 "blood neutrophil count") AnnotationAssertion(rdfs:label efo:EFO_0004833 "neutrophil count") SubClassOf(efo:EFO_0004833 efo:EFO_0007987) +SubClassOf(efo:EFO_0004833 efo:EFO_0803548) SubClassOf(efo:EFO_0004833 ObjectUnionOf(ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:GO_0006954) ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 efo:EFO_0000565) ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 efo:EFO_0000612) ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 efo:EFO_0005140) ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 efo:EFO_0005741))) SubClassOf(efo:EFO_0004833 ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:CL_0000081)) SubClassOf(efo:EFO_0004833 ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:CL_0000775)) @@ -123256,6 +123258,7 @@ AnnotationAssertion(oboInOwl:hasDbXref efo:EFO_0004842 "SNOMEDCT:71960002") AnnotationAssertion(oboInOwl:hasExactSynonym efo:EFO_0004842 "blood eosinophil count") AnnotationAssertion(rdfs:label efo:EFO_0004842 "eosinophil count") SubClassOf(efo:EFO_0004842 efo:EFO_0007987) +SubClassOf(efo:EFO_0004842 efo:EFO_0803540) SubClassOf(efo:EFO_0004842 ObjectUnionOf(ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:MONDO_0005271) ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 efo:EFO_0003099))) SubClassOf(efo:EFO_0004842 ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:CL_0000081)) SubClassOf(efo:EFO_0004842 ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:CL_0000771)) @@ -125112,6 +125115,7 @@ AnnotationAssertion(oboInOwl:hasDbXref efo:EFO_0005090 "SNOMEDCT:42351005") AnnotationAssertion(oboInOwl:hasExactSynonym efo:EFO_0005090 "blood basophil count") AnnotationAssertion(rdfs:label efo:EFO_0005090 "basophil count") SubClassOf(efo:EFO_0005090 efo:EFO_0007987) +SubClassOf(efo:EFO_0005090 efo:EFO_0803539) SubClassOf(efo:EFO_0005090 ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:CL_0000081)) SubClassOf(efo:EFO_0005090 ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:CL_0000767)) SubClassOf(efo:EFO_0005090 ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:GO_0006954)) @@ -125126,6 +125130,7 @@ AnnotationAssertion(oboInOwl:hasDbXref efo:EFO_0005091 "NCIt:C64823") AnnotationAssertion(oboInOwl:hasDbXref efo:EFO_0005091 "SNOMEDCT:67776007") AnnotationAssertion(rdfs:label efo:EFO_0005091 "monocyte count") SubClassOf(efo:EFO_0005091 efo:EFO_0004308) +SubClassOf(efo:EFO_0005091 efo:EFO_0803547) SubClassOf(efo:EFO_0005091 ObjectUnionOf(ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 efo:EFO_0000565) ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 efo:EFO_0005741))) SubClassOf(efo:EFO_0005091 ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:CL_0000081)) SubClassOf(efo:EFO_0005091 ObjectSomeValuesFrom(obo:IAO_0000136 obo:CL_0000576)) @@ -232173,7 +232178,7 @@ AnnotationAssertion(obo:IAO_0000115 efo:EFO_0803542 "The number of immature gran AnnotationAssertion(obo:IAO_0000117 efo:EFO_0803542 "Elizabeth Lewis") AnnotationAssertion(oboInOwl:hasDbXref efo:EFO_0803542 "PMID:37596262") AnnotationAssertion(rdfs:label efo:EFO_0803542 "immature granulocyte count") -SubClassOf(efo:EFO_0803542 efo:EFO_0007987) +SubClassOf(efo:EFO_0803542 efo:EFO_0803543) # Class: efo:EFO_0803543 (immature granulocyte measurement) @@ -232182,6 +232187,7 @@ AnnotationAssertion(obo:IAO_0000117 efo:EFO_0803543 "Elizabeth Lewis") AnnotationAssertion(oboInOwl:hasDbXref efo:EFO_0803543 "PMID:37596262") AnnotationAssertion(rdfs:label efo:EFO_0803543 "immature granulocyte measurement") SubClassOf(efo:EFO_0803543 efo:EFO_0004503) +SubClassOf(efo:EFO_0803543 efo:EFO_0007987) # Class: efo:EFO_0803544 (immature platelet count) @@ -232198,6 +232204,7 @@ AnnotationAssertion(obo:IAO_0000117 efo:EFO_0803545 "Elizabeth Lewis") AnnotationAssertion(oboInOwl:hasDbXref efo:EFO_0803545 "PMID:37596262") AnnotationAssertion(rdfs:label efo:EFO_0803545 "immature reticulocyte measurement") SubClassOf(efo:EFO_0803545 efo:EFO_0004503) +SubClassOf(efo:EFO_0803545 efo:EFO_0010700) # Class: efo:EFO_0803546 (lymphocyte measurement)