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Cython:Cython 语法,调用其他C库

Cython 语法

cdef 关键词

cdef 定义 C 类型变量。

可以定义局部变量:

def fib(int n):
    cdef int a,b,i
    ...

定义函数返回值:

cdef float distance(float *x, float *y, int n):
    cdef:
        int i
        float d = 0.0
    for i in range(n):
        d += (x[i] - y[i]) ** 2
    return d

定义函数:

cdef class Particle(object):
    cdef float psn[3], vel[3]
    cdef int id

注意函数的参数不需要使用 cdef 的定义。

def, cdef, cpdef 函数

Cython 一共有三种定义方式,def, cdef, cpdef 三种:

  • def - Python, Cython 都可以调用
  • cdef - 更快,只能 Cython 调用,可以使用指针
  • cpdef - Python, Cython 都可以调用,不能使用指针

cimport

In [1]:

from math import sin as pysin
from numpy import sin as npsin

In [2]:

%load_ext Cython

从标准 C 语言库中调用模块,cimport 只能在 Cython 中使用:

In [3]:

%%cython
from libc.math cimport sin
from libc.stdlib cimport malloc, free

cimport 和 pxd 文件

如果想在多个文件中复用 Cython 代码,可以定义一个 .pxd 文件(相当于头文件 .h)定义方法,这个文件对应于一个 .pyx 文件(相当于源文件 .c),然后在其他的文件中使用 cimport 导入:

fib.pxd, fib.pyx 文件存在,那么可以这样调用:

from fib cimport fib

还可以调用 C++ 标准库和 Numpy C Api 中的文件:

from libcpp.vector cimport vector
cimport numpy as cnp

调用其他C库

从标准库 string.h 中调用 strlen

In [4]:

%%file len_extern.pyx
cdef extern from "string.h":
    int strlen(char *c)

def get_len(char *message):
    return strlen(message)
Writing len_extern.pyx

不过 Cython 不会自动扫描导入的头文件,所以要使用的函数必须再声明一遍:

In [5]:

%%file setup_len_extern.py
from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Distutils import build_ext

setup(
  ext_modules=[ Extension("len_extern", ["len_extern.pyx"]) ],
  cmdclass = {'build_ext': build_ext}
)
Writing setup_len_extern.py

编译:

In [6]:

!python setup_len_extern.py build_ext --inplace
running build_ext
cythoning len_extern.pyx to len_extern.c
building 'len_extern' extension
creating build
creating build\temp.win-amd64-2.7
creating build\temp.win-amd64-2.7\Release
C:\Miniconda\Scripts\gcc.bat -DMS_WIN64 -mdll -O -Wall -IC:\Miniconda\include -IC:\Miniconda\PC -c len_extern.c -o build\temp.win-amd64-2.7\Release\len_extern.o
writing build\temp.win-amd64-2.7\Release\len_extern.def
C:\Miniconda\Scripts\gcc.bat -DMS_WIN64 -shared -s build\temp.win-amd64-2.7\Release\len_extern.o build\temp.win-amd64-2.7\Release\len_extern.def -LC:\Miniconda\libs -LC:\Miniconda\PCbuild\amd64 -lpython27 -lmsvcr90 -o "C:\Users\Jin\Documents\Git\python-tutorial\07\. interfacing with other languages\len_extern.pyd"

Python 中调用:

In [7]:

import len_extern

调用这个模块后,并不能直接使用 strlen 函数,可以看到,这个模块中并没有 strlen 这个函数:

In [8]:

dir(len_extern)

Out[8]:

['__builtins__',
 '__doc__',
 '__file__',
 '__name__',
 '__package__',
 '__test__',
 'get_len']

不过可以调用 get_len 函数:

In [9]:

len_extern.get_len('hello')

Out[9]:

5

因为调用的是 C 函数,所以函数的表现与 C 语言的用法一致,例如 C 语言以 \0 为字符串的结束符,所以会出现这样的情况:

In [10]:

len_extern.get_len('hello\0world!')

Out[10]:

5

除了对已有的 C 函数进行调用,还可以对已有的 C 结构体进行调用和修改:

In [11]:

%%file time_extern.pyx
cdef extern from "time.h":

    struct tm:
        int tm_mday
        int tm_mon
        int tm_year

    ctypedef long time_t
    tm* localtime(time_t *timer)
    time_t time(time_t *tloc)

def get_date():
    """Return a tuple with the current day, month and year."""
    cdef time_t t
    cdef tm* ts
    t = time(NULL)
    ts = localtime(&t)
    return ts.tm_mday, ts.tm_mon + 1, ts.tm_year + 1900
Writing time_extern.pyx

这里我们只使用 tm 结构体的年月日信息,所以只声明了要用了三个属性。

In [12]:

%%file setup_time_extern.py
from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Distutils import build_ext

setup(
  ext_modules=[ Extension("time_extern", ["time_extern.pyx"]) ],
  cmdclass = {'build_ext': build_ext}
)
Writing setup_time_extern.py

编译:

In [13]:

!python setup_time_extern.py build_ext --inplace
running build_ext
cythoning time_extern.pyx to time_extern.c
building 'time_extern' extension
C:\Miniconda\Scripts\gcc.bat -DMS_WIN64 -mdll -O -Wall -IC:\Miniconda\include -IC:\Miniconda\PC -c time_extern.c -o build\temp.win-amd64-2.7\Release\time_extern.o
writing build\temp.win-amd64-2.7\Release\time_extern.def
C:\Miniconda\Scripts\gcc.bat -DMS_WIN64 -shared -s build\temp.win-amd64-2.7\Release\time_extern.o build\temp.win-amd64-2.7\Release\time_extern.def -LC:\Miniconda\libs -LC:\Miniconda\PCbuild\amd64 -lpython27 -lmsvcr90 -o "C:\Users\Jin\Documents\Git\python-tutorial\07\. interfacing with other languages\time_extern.pyd"

测试:

In [14]:

import time_extern

time_extern.get_date()

Out[14]:

(19, 9, 2015)

清理文件:

In [15]:

import zipfile

f = zipfile.ZipFile('07-04-extern.zip','w',zipfile.ZIP_DEFLATED)

names = ['setup_len_extern.py',
         'len_extern.pyx',
         'setup_time_extern.py',
         'time_extern.pyx']
for name in names:
    f.write(name)

f.close()

!rm -f setup*.*
!rm -f len_extern.*
!rm -f time_extern.*
!rm -rf build