-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
Copy pathindex.html
332 lines (290 loc) · 14.8 KB
/
index.html
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
<!doctype html>
<html>
<head>
<title>Regovar</title>
<link rel="alternate" type="application/rss+xml" title="RSS 2.0" href="/blog/feed">
<meta name="description" content="Regovar est un logiciel d'analyse de données génétiques libre et ouvert, financé par les CHU du Grand Ouest.">
<meta charset="utf-8">
<meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=edge">
<meta name="viewport" content="width=480, user-scalable=yes">
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="theme/css/regovar.css">
<link rel="icon" href="favicon.ico">
<link rel="icon" size="64x64" href="favicon.ico">
<link rel="icon" sizes="192x192" href="icon.png">
<link rel="apple-touch-icon-precomposed" sizes="192x192" href="icon.png">
<script type="text/javascript">
var plat = 'windows'
if (/Mac OS X/.test(navigator.userAgent))
plat = 'osx'
else if (/Linux|FreeBSD/.test(navigator.userAgent))
plat = 'linux'
var arch = /WOW64|Win64|x86_64/.test(navigator.userAgent) ? '64' : '32'
document.documentElement.className += ' plat_' + plat + ' arch_' + arch
function byid(x)
{
return document.getElementById(x)
}
var scale = 1
function res()
{
scale = window.devicePixelRatio >= 1.3 && document.body.clientWidth > 1024 ? 2 : 1
return scale == 2 ? '@2x' : ''
}
</script>
<!--[if lt IE 9]>
<script>
var els = ['header', 'nav', 'section', 'main', 'article', 'aside', 'footer']
for (var i = 0; i < els.length; ++i)
document.createElement(els[i]);
</script>
<style>
header, nav, section, main, article, aside, footer {
display: block;
}
</style>
<![endif]-->
</head>
<body>
<header>
<section>
<a id="logo" href="/">
<img src="theme/logo.png" alt="Regovar">
</a>
<nav>
<a href="fr/download.html">Téléchargement</a>
<a href="fr/blog.html">Blog</a>
<a href="fr/documentation.html">Documentation</a>
<a href="fr/support.html">Support</a>
<a href="fr/contribute.html">Contribuer</a>
<a href="fr/donate.html">Nous soutenir</a>
</nav>
</section>
</header>
<script>
var width = 1200
var height = 576
</script>
<div id="masthead">
<section>
<div class="tagline"><span>L'analyse NGS libre et open source</span></div>
</section>
<div class="download">
<div class="button">
<span class="all"><a href="https://regovar.readthedocs.io/fr/latest/installation/saltstack/">Installer le serveur<br><small>Version 0.12.0</small></a></span>
</div>
<div class="button">
<span class="win show_32"><a href="https://github.com/REGOVAR/QRegovar/releases/download/v0.13.1/regovar-client_0.13.1_x86-32.zip">Télécharger pour Windows<br><small>Version 0.13.1</small></a></span>
<span class="win show_64"><a href="https://github.com/REGOVAR/QRegovar/releases/download/v0.13.1/regovar-client_0.13.1_x86-64.zip">Télécharger pour Windows<br><small>Version 0.13.1</small></a></span>
<span class="linux"><a href="https://github.com/REGOVAR/QRegovar/archive/v0.13.1.tar.gz">Télécharger pour Linux<br>Version 0.13.1</a></span>
<span class="mac"><a href="https://github.com/REGOVAR/QRegovar/archive/v0.13.1.tar.gz">Télécharger pour macOS<br>Version 0.13.1</a></span>
</div>
</div>
<section id="slideshow" class="slideshow">
<div class="slideshow-container">
<!-- Full-width images with number and caption text -->
<div class="mySlides">
<img src="fr/img/slide-1.jpg" style="width:100%">
</div>
<div class="mySlides">
<img src="fr/img/slide-2.jpg" style="width:100%">
</div>
<div class="mySlides">
<img src="fr/img/slide-3.jpg" style="width:100%">
</div>
<div class="mySlides">
<img src="fr/img/slide-4.jpg" style="width:100%">
</div>
<div class="mySlides">
<img src="fr/img/slide-5.jpg" style="width:100%">
</div>
<div class="mySlides">
<img src="fr/img/slide-6.jpg" style="width:100%">
</div>
<div class="mySlides">
<img src="fr/img/slide-7.jpg" style="width:100%">
</div>
<!-- <div class="mySlides">
<img src="fr/img/slide-8.jpg" style="width:100%">
</div> -->
<!-- Next and previous buttons
<a class="prev" onclick="plusSlides(-1)">❮</a>
<a class="next" onclick="plusSlides(1)">❯</a>
-->
</div>
</section>
</div>
<main>
<section class="screencast-meta">
<div style="text-align:center">
<span class="dot" onclick="currentSlide(1)"></span>
<span class="dot" onclick="currentSlide(2)"></span>
<span class="dot" onclick="currentSlide(3)"></span>
<span class="dot" onclick="currentSlide(4)"></span>
<span class="dot" onclick="currentSlide(5)"></span>
<span class="dot" onclick="currentSlide(6)"></span>
<span class="dot" onclick="currentSlide(7)"></span>
<!-- <span class="dot" onclick="currentSlide(8)"></span> -->
</div>
<div class="captions">
<div class="myCaptions fade">
<b>Interface <span class="feature">simple et moderne</span></b>
Un grand soin a été apporté pour que l'application soit simple et agréable à utiliser par tous les utilisateurs.
</div>
<div class="myCaptions fade">
<b>Filtrage <span class="feature">dynamique</span> des variants</b>
Utilisez des filtres prédéfinis ou élaborez vos propres filtres pour des cas plus complexes.
</div>
<div class="myCaptions fade">
<b>Pipelines bioinformatiques</b>
En quelques clics, appliquez sur vos données des traitements automatisés et personnalisés, qu'il s'agisse des vôtres ou de ceux proposés par la communauté.
</div>
<div class="myCaptions fade">
<b>Phénotypes et maladies - <span class="feature">OMIM, HPO, Orphanet, DECIPHER</span>)</b>
Stockez les données des patients dans une fiche patient : informations administratives, phénotype, historique des analyses réalisées, résultats, liens familiaux, documents annexes (consentements, photos, arbres généalogiques…) et utilisez ces données pour faciliter les analyses.
</div>
<div class="myCaptions fade">
<b>Panel de gènes</b>
Créez vos panels de gènes, tenez-les à jour, partagez-les et utilisez ceux mis à disposition par la communauté.
</div>
<div class="myCaptions fade">
<b>Moteur de recherche global</b>
Accédez rapidement à n'importe quelle donnée, qu'il s'agisse d'un variant, d'un gène, d'un phénotype, d'un individu, d'un échantillon, d'un panel, d'une analyse, d'un rapport, d'un pipeline…
</div>
<div class="myCaptions fade">
<b>Administrez</b>
Supervisez en temps réel l'état du serveur et de la base de données.
</div>
<!-- <div class="myCaptions fade">
<b>Participer !</b>
Le projet n'est pas terminé, de nombreuse autres idées sont en cours de développement. N'hésitez pas à <a href="fr/contribute.html">participer à l'aventure</a>.
</div> -->
</div>
</section>
<section>
<h2 class="love"><span>Quelques points clés</span></h2>
<div class="feature odd">
<h3>PHRCI Grand Ouest</h3>
<p>Regovar est un projet de recherche financé par les <a href="http://www.girci-go.org/GIRCI_GO/membres.html">CHU du réseau HUGO</a>.
Il vise à développer un logiciel d'analyse de données de séquençage haut débit, depuis la récupération des fichiers produits par les séquenceurs, jusqu'à la génération de rapports, de comptes-rendus d'analyse en passant par les contrôles de qualité, la détection, l'annotation, le filtrage, la priorisation
et la visualisation de variants.</p>
</div>
<div class="feature even">
<h3>Libre et open-source</h3>
<p>Pas de contraintes contractuelles ni budgétaires. Regovar est un logiciel libre (sous licence
<a href="https://github.com/REGOVAR/Regovar/blob/master/LICENSE">AGPLv3</a>)
et gratuit, tout comme les technologies sur lesquelles il se base.</p>
<p>Rejoignez les sept CHU impliqués dans ce projet collaboratif sans limites institutionnelles ou géographiques.</p>
</div>
<div class="feature odd">
<h3>Panel, exome, génome</h3>
<p>La base de données de Regovar a été conçue pour permettre le traitement efficace de grandes quantités de données liées à l'analyse régulière de génomes. La souplesse des outils développés pour Regovar permet de manipuler ces données facilement, que l'on travaille sur des panels de gènes, des exomes ou des génomes complets.</p>
</div>
<div class="feature even">
<h3>Diagnostic et recherche</h3>
<p>Regovar a été conçu pour une utilisation aussi bien en recherche qu'en diagnostic. Afin de répondre aux normes requises pour le diagnostic, Regovar garantit une tracabilité exhaustive des actions réalisées sur les données et de rejouer n'importe quelle analyse dans les conditions d'origine.</p>
<p>Pour les cas nécessitant une recherche plus approfondie, Regovar offre la possibilité de créer des filtres complexes et de tester en quelques clics d'autres pipelines mis à disposition.</p>
</div>
<div class="feature odd">
<h3>Simple et moderne</h3>
<p>L'interface ergonomique s'adresse à la fois aux cliniciens, aux biologistes et aux bioinformaticiens. </p>
</div>
<div class="feature even">
<h3>Moteur de recherche convivial</h3>
<p>Recherchez à la fois parmi vos données locales, celles d'OMIM, de Human Phenotype Ontology, de PubMed…
Accédez rapidement aux outils en ligne tel que Varsome.</p>
</div>
<div class="feature odd">
<h3>Base de données</h3>
<p>Sauvegardez vos données NGS et vos annotations dans une base de données locale et sécurisée.</p>
</div>
<div class="feature even">
<h3>Pipelines</h3>
<p>Créez et ajoutez vos pipelines ou utilisez ceux déjà disponibles.</p>
</div>
<div class="feature odd">
<h3>Partage</h3>
<p>Partagez si vous le désirez vos pipelines et vos panels. Vous pourrez prochainement partager vos filtres ainsi que vos annotations et statistiques sur les variants.</p>
</div>
<div class="feature even">
<h3>Technologies fiables et modernes</h3>
<p>Python, Qt, PostgreSQL, Docker, NGINX…</p>
</div>
<div class="feature odd">
<h3>Performance</h3>
<p>Filtrez vos variants en quelques secondes, accédez à vos données aisément et rapidement.</p>
</div>
<div class="feature even">
<h3>Multi plateformes</h3>
<p>L'application est compatible avec Windows, Linux et macOS.</p>
</div>
</section>
</main>
<footer>
<section class="partners">
<img src="theme/logo_chu_angers.png" alt="CHU d'Angers" height="70px"/>
<img src="theme/logo_univ_Angers.png" alt="Université d'Angers " height="70px"/>
<img src="theme/logo_CHRU_Brest.jpg" alt="CHU de Brest" height="70px"/>
<img src="theme/logo_CHU_Nancy.png" alt="CHU de Nancy" height="70px"/>
<img src="theme/logo_CHU_Nantes.png" alt="CHU de Nantes" height="70px"/>
<img src="theme/logo_CHU_Poitiers.jpg" alt="CHU de Poitiers" height="70px"/>
<img src="theme/logo_CHU_Rennes.jpg" alt="CHU de Rennes" height="70px"/>
<img src="theme/logo_CHU_Tours.jpg" alt="CHU de Tours" height="70px"/>
</section>
<section class="hugo">
<div style="width: 1200px; margin:auto">
<div class="feature odd">
<a href="http://www.girci-go.org/GIRCI_GO/membres.html" class="girci_logo"><span>GIRCI Grand Ouest</span></a>
</div>
<div class="feature even">
<a href="http://www.girci-go.org/GIRCI_GO/membres.html" class="hugo_logo"><span>Réseau HUGO</span></a>
</div>
</div>
</section>
</footer>
<!--[if lt IE 9]>
<script>
var logo_img = byid('logo').getElementsByTagName('IMG')[0]
logo_img.src = logo_img.src.replace('.svg', '.png')
</script>
<![endif]-->
<script type="text/javascript">
var slideIndex = 1;
var slideTimer;
// Next/previous controls
function plusSlides(n)
{
showSlides(slideIndex += n);
}
// Thumbnail image controls
function currentSlide(n)
{
showSlides(slideIndex = n);
}
function showSlides(n)
{
clearTimeout(slideTimer);
var i;
var slides = document.getElementsByClassName("mySlides");
var captions = document.getElementsByClassName("myCaptions");
var dots = document.getElementsByClassName("dot");
if (n > slides.length) {slideIndex = 1}
if (n < 1) {slideIndex = slides.length}
for (i = 0; i < slides.length; i++)
{
slides[i].style.display = "none";
captions[i].style.display = "none";
}
for (i = 0; i < dots.length; i++)
{
dots[i].className = dots[i].className.replace(" active", "");
captions[i].className = captions[i].className.replace(" active", "");
}
slides[slideIndex-1].style.display = "block";
captions[slideIndex-1].style.display = "block";
dots[slideIndex-1].className += " active";
slideTimer = setTimeout(function(){ plusSlides(1); }, 10000);
}
showSlides(1);
</script>
</body>
</html>