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# Copyright 2010 Torbjorn Bjorkman
# This file is part of cif2cell
#
# cif2cell is free software: you can redistribute it and/or modify
# it under the terms of the GNU General Public License as published by
# the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
# (at your option) any later version.
#
# cif2cell is distributed in the hope that it will be useful,
# but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
# MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
# GNU General Public License for more details.
#
# You should have received a copy of the GNU General Public License
# along with cif2cell. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
#
#******************************************************************************************
# Description: Chemical element data useful for generating setups for electronic
# structure programs.
# Author: Torbjorn Bjorkman, torbjorn.bjorkman(at)aalto.fi
# Affiliation: COMP, Aaalto University School of Science,
# Department of Applied Physics, Espoo, Finland
#******************************************************************************************
class ElementData:
"""
Class for storing some data about the chemical elements.
elementnr : dictionary of the element numbers.
Example: elementnr['O'] is 8.
valenceelectrons : Number of valence electrons.
elementperiod : Which period?
elementgroup : Which group?
elementblock : dictionary of which block an element belong to (spdf).
Example: elementblock['Fe'] is 'd'
elementweight : dictionary of atomic weights (IUPAC 2009)
angularmomentum : dictionary for the angular momentum quantum number of s,p,d,f states
CovalentRadius : From environmentalchemistry
CovalentRadius2 : From Jmol.
IonicRadius : From Jmol.
ElectroNegativityPauling
ElectroNegativitySanderson
ElectronNegativityAllredRochow
ElectronegativityMullikenJaffe
ElectronegativityAllen
emtoelements : element setups for EMTO
"""
def __init__(self):
# Element numbers
self.elementnr = {
'Em' : 0 , # empty site
'Vc' : 0 , # empty site
'Va' : 0 , # empty site
'H' : 1 ,
'D' : 1 ,
'He' : 2 ,
'Li' : 3 ,
'Be' : 4 ,
'B' : 5 ,
'C' : 6 ,
'N' : 7 ,
'O' : 8 ,
'F' : 9 ,
'Ne' : 10 ,
'Na' : 11 ,
'Mg' : 12 ,
'Al' : 13 ,
'Si' : 14 ,
'P' : 15 ,
'S' : 16 ,
'Cl' : 17 ,
'Ar' : 18 ,
'K' : 19 ,
'Ca' : 20 ,
'Sc' : 21 ,
'Ti' : 22 ,
'V' : 23 ,
'Cr' : 24 ,
'Mn' : 25 ,
'Fe' : 26 ,
'Co' : 27 ,
'Ni' : 28 ,
'Cu' : 29 ,
'Zn' : 30 ,
'Ga' : 31 ,
'Ge' : 32 ,
'As' : 33 ,
'Se' : 34 ,
'Br' : 35 ,
'Kr' : 36 ,
'Rb' : 37 ,
'Sr' : 38 ,
'Y' : 39 ,
'Zr' : 40 ,
'Nb' : 41 ,
'Mo' : 42 ,
'Tc' : 43 ,
'Ru' : 44 ,
'Rh' : 45 ,
'Pd' : 46 ,
'Ag' : 47 ,
'Cd' : 48 ,
'In' : 49 ,
'Sn' : 50 ,
'Sb' : 51 ,
'Te' : 52 ,
'I' : 53 ,
'Xe' : 54 ,
'Cs' : 55 ,
'Ba' : 56 ,
'La' : 57 ,
'Ce' : 58 ,
'Pr' : 59 ,
'Nd' : 60 ,
'Pm' : 61 ,
'Sm' : 62 ,
'Eu' : 63 ,
'Gd' : 64 ,
'Tb' : 65 ,
'Dy' : 66 ,
'Ho' : 67 ,
'Er' : 68 ,
'Tm' : 69 ,
'Yb' : 70 ,
'Lu' : 71 ,
'Hf' : 72 ,
'Ta' : 73 ,
'W' : 74 ,
'Re' : 75 ,
'Os' : 76 ,
'Ir' : 77 ,
'Pt' : 78 ,
'Au' : 79 ,
'Hg' : 80 ,
'Tl' : 81 ,
'Pb' : 82 ,
'Bi' : 83 ,
'Po' : 84 ,
'At' : 85 ,
'Rn' : 86 ,
'Fr' : 87 ,
'Ra' : 88 ,
'Ac' : 89 ,
'Th' : 90 ,
'Pa' : 91 ,
'U' : 92 ,
'Np' : 93 ,
'Pu' : 94 ,
'Am' : 95 ,
'Cm' : 96 ,
'Bk' : 97 ,
'Cf' : 98 ,
'Es' : 99 ,
'Fm' : 100,
'Me' : 101,
'No' : 102,
'Lr' : 103,
'Rf' : 104,
'Db' : 105,
'Sg' : 106,
'Bh' : 107,
'Hs' : 108,
'Mt' : 109,
'Uun': 110,
'Uuu': 111,
'Uub': 112}
self.valenceelectrons = {
'Em' : 0 , # empty site
'Vc' : 0 , # empty site
'Va' : 0 , # empty site
'H' : 1 ,
'D' : 1 ,
'He' : 0 ,
'Li' : 1 ,
'Be' : 2 ,
'B' : 3 ,
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'N' : 5 ,
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'Sr' : 2 ,
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'Mo' : 6 ,
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'Cd' : 2 ,
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'Sn' : 4 ,
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'Te' : 6 ,
'I' : 7 ,
'Xe' : 0 ,
'Cs' : 1 ,
'Ba' : 2 ,
'La' : 3 ,
'Ce' : 2 ,
'Pr' : 2 ,
'Nd' : 2 ,
'Pm' : 2 ,
'Sm' : 2 ,
'Eu' : 2 ,
'Gd' : 2 ,
'Tb' : 2 ,
'Dy' : 2 ,
'Ho' : 2 ,
'Er' : 2 ,
'Tm' : 2 ,
'Yb' : 2 ,
'Lu' : 3 ,
'Hf' : 4 ,
'Ta' : 5 ,
'W' : 6 ,
'Re' : 7 ,
'Os' : 8 ,
'Ir' : 9 ,
'Pt' : 10 ,
'Au' : 1 ,
'Hg' : 2 ,
'Tl' : 3 ,
'Pb' : 4 ,
'Bi' : 5 ,
'Po' : 6 ,
'At' : 7 ,
'Rn' : 0 ,
'Fr' : 1 ,
'Ra' : 2 ,
'Ac' : 3 ,
'Th' : 4 ,
'Pa' : 5 ,
'U' : 6 ,
'Np' : 7 ,
'Pu' : 8 ,
'Am' : 2 ,
'Cm' : 2 ,
'Bk' : 2 ,
'Cf' : 2 ,
'Es' : 2 }
# Periods
self.elementperiod = {
'H' : 1 ,
'D' : 1 ,
'He' : 2 ,
'Li' : 2 ,
'Be' : 2 ,
'B' : 2 ,
'C' : 2 ,
'N' : 2 ,
'O' : 2 ,
'F' : 2 ,
'Ne' : 2 ,
'Na' : 3 ,
'Mg' : 3 ,
'Al' : 3 ,
'Si' : 3 ,
'P' : 3 ,
'S' : 3 ,
'Cl' : 3 ,
'Ar' : 3 ,
'K' : 4 ,
'Ca' : 4 ,
'Sc' : 4 ,
'Ti' : 4 ,
'V' : 4 ,
'Cr' : 4 ,
'Mn' : 4 ,
'Fe' : 4 ,
'Co' : 4 ,
'Ni' : 4 ,
'Cu' : 4 ,
'Zn' : 4 ,
'Ga' : 4 ,
'Ge' : 4 ,
'As' : 4 ,
'Se' : 4 ,
'Br' : 4 ,
'Kr' : 4 ,
'Rb' : 5 ,
'Sr' : 5 ,
'Y' : 5 ,
'Zr' : 5 ,
'Nb' : 5 ,
'Mo' : 5 ,
'Tc' : 5 ,
'Ru' : 5 ,
'Rh' : 5 ,
'Pd' : 5 ,
'Ag' : 5 ,
'Cd' : 5 ,
'In' : 5 ,
'Sn' : 5 ,
'Sb' : 5 ,
'Te' : 5 ,
'I' : 5 ,
'Xe' : 5 ,
'Cs' : 6 ,
'Ba' : 6 ,
'La' : 6 ,
'Ce' : 6 ,
'Pr' : 6 ,
'Nd' : 6 ,
'Pm' : 6 ,
'Sm' : 6 ,
'Eu' : 6 ,
'Gd' : 6 ,
'Tb' : 6 ,
'Dy' : 6 ,
'Ho' : 6 ,
'Er' : 6 ,
'Tm' : 6 ,
'Yb' : 6 ,
'Lu' : 6 ,
'Hf' : 6 ,
'Ta' : 6 ,
'W' : 6 ,
'Re' : 6 ,
'Os' : 6 ,
'Ir' : 6 ,
'Pt' : 6 ,
'Au' : 6 ,
'Hg' : 6 ,
'Tl' : 6 ,
'Pb' : 6 ,
'Bi' : 6 ,
'Po' : 6 ,
'At' : 6 ,
'Rn' : 6 ,
'Fr' : 7 ,
'Ra' : 7 ,
'Ac' : 7 ,
'Th' : 7 ,
'Pa' : 7 ,
'U' : 7 ,
'Np' : 7 ,
'Pu' : 7 ,
'Am' : 7 ,
'Cm' : 7 ,
'Bk' : 7 ,
'Cf' : 7 ,
'Es' : 7 ,
'Fm' : 7 ,
'Me' : 7 ,
'No' : 7 ,
'Lr' : 7 ,
'Rf' : 7 ,
'Db' : 7 ,
'Sg' : 7 ,
'Bh' : 7 ,
'Hs' : 7 ,
'Mt' : 7 ,
'Uun': 7 ,
'Uuu': 7 ,
'Uub': 7 }
# Element groups
self.elementgroup = {
'H' : 1 ,
'D' : 1 ,
'He' : 18 ,
'Li' : 1 ,
'Be' : 2 ,
'B' : 13 ,
'C' : 14 ,
'N' : 15 ,
'O' : 16 ,
'F' : 17 ,
'Ne' : 18 ,
'Na' : 1 ,
'Mg' : 2 ,
'Al' : 13 ,
'Si' : 14 ,
'P' : 15 ,
'S' : 16 ,
'Cl' : 17 ,
'Ar' : 18 ,
'K' : 1 ,
'Ca' : 2 ,
'Sc' : 3 ,
'Ti' : 4 ,
'V' : 5 ,
'Cr' : 6 ,
'Mn' : 7 ,
'Fe' : 8 ,
'Co' : 9 ,
'Ni' : 10 ,
'Cu' : 11 ,
'Zn' : 12 ,
'Ga' : 13 ,
'Ge' : 14 ,
'As' : 15 ,
'Se' : 16 ,
'Br' : 17 ,
'Kr' : 18 ,
'Rb' : 1 ,
'Sr' : 2 ,
'Y' : 3 ,
'Zr' : 4 ,
'Nb' : 5 ,
'Mo' : 6 ,
'Tc' : 7 ,
'Ru' : 8 ,
'Rh' : 9 ,
'Pd' : 10 ,
'Ag' : 11 ,
'Cd' : 12 ,
'In' : 13 ,
'Sn' : 14 ,
'Sb' : 15 ,
'Te' : 16 ,
'I' : 17 ,
'Xe' : 18 ,
'Cs' : 1 ,
'Ba' : 2 ,
'La' : 19 ,
'Ce' : 19 ,
'Pr' : 19 ,
'Nd' : 19 ,
'Pm' : 19 ,
'Sm' : 19 ,
'Eu' : 19 ,
'Gd' : 19 ,
'Tb' : 19 ,
'Dy' : 19 ,
'Ho' : 19 ,
'Er' : 19 ,
'Tm' : 19 ,
'Yb' : 19 ,
'Lu' : 3 ,
'Hf' : 4 ,
'Ta' : 5 ,
'W' : 6 ,
'Re' : 7 ,
'Os' : 8 ,
'Ir' : 9 ,
'Pt' : 10 ,
'Au' : 11 ,
'Hg' : 12 ,
'Tl' : 13 ,
'Pb' : 14 ,
'Bi' : 15 ,
'Po' : 16 ,
'At' : 17 ,
'Rn' : 18 ,
'Fr' : 1 ,
'Ra' : 2 ,
'Ac' : 19 ,
'Th' : 19 ,
'Pa' : 19 ,
'U' : 19 ,
'Np' : 19 ,
'Pu' : 19 ,
'Am' : 19 ,
'Cm' : 19 ,
'Bk' : 19 ,
'Cf' : 19 ,
'Es' : 19 ,
'Fm' : 19 ,
'Me' : 19 ,
'No' : 19 ,
'Lr' : 3 ,
'Rf' : 4 ,
'Db' : 5 ,
'Sg' : 6 ,
'Bh' : 7 ,
'Hs' : 8 ,
'Mt' : 9 ,
'Uun': 10 ,
'Uuu': 11 ,
'Uub': 12 }
# Element classification in s, p, d and f blocks
self.elementblock = {
'Em' : 's' , # empty site
'Vc' : 's' , # empty site
'Va' : 's' , # empty site
'H' : 's' ,
'D' : 's' ,
'He' : 's' ,
'Li' : 's' ,
'Be' : 's' ,
'B' : 'p' ,
'C' : 'p' ,
'N' : 'p' ,
'O' : 'p' ,
'F' : 'p' ,
'Ne' : 'p' ,
'Na' : 's' ,
'Mg' : 's' ,
'Al' : 'p' ,
'Si' : 'p' ,
'P' : 'p' ,
'S' : 'p' ,
'Cl' : 'p' ,
'Ar' : 'p' ,
'K' : 's' ,
'Ca' : 's' ,
'Sc' : 'd' ,
'Ti' : 'd' ,
'V' : 'd' ,
'Cr' : 'd' ,
'Mn' : 'd' ,
'Fe' : 'd' ,
'Co' : 'd' ,
'Ni' : 'd' ,
'Cu' : 'd' ,
'Zn' : 'd' ,
'Ga' : 'p' ,
'Ge' : 'p' ,
'As' : 'p' ,
'Se' : 'p' ,
'Br' : 'p' ,
'Kr' : 'p' ,
'Rb' : 's' ,
'Sr' : 's' ,
'Y' : 'd' ,
'Zr' : 'd' ,
'Nb' : 'd' ,
'Mo' : 'd' ,
'Tc' : 'd' ,
'Ru' : 'd' ,
'Rh' : 'd' ,
'Pd' : 'd' ,
'Ag' : 'd' ,
'Cd' : 'd' ,
'In' : 'p' ,
'Sn' : 'p' ,
'Sb' : 'p' ,
'Te' : 'p' ,
'I' : 'p' ,
'Xe' : 'p' ,
'Cs' : 's' ,
'Ba' : 's' ,
'La' : 'f' ,
'Ce' : 'f' ,
'Pr' : 'f' ,
'Nd' : 'f' ,
'Pm' : 'f' ,
'Sm' : 'f' ,
'Eu' : 'f' ,
'Gd' : 'f' ,
'Tb' : 'f' ,
'Dy' : 'f' ,
'Ho' : 'f' ,
'Er' : 'f' ,
'Tm' : 'f' ,
'Yb' : 'f' ,
'Lu' : 'f' ,
'Hf' : 'd' ,
'Ta' : 'd' ,
'W' : 'd' ,
'Re' : 'd' ,
'Os' : 'd' ,
'Ir' : 'd' ,
'Pt' : 'd' ,
'Au' : 'd' ,
'Hg' : 'd' ,
'Tl' : 'p' ,
'Pb' : 'p' ,
'Bi' : 'p' ,
'Po' : 'p' ,
'At' : 'p' ,
'Rn' : 'p' ,
'Fr' : 's' ,
'Ra' : 's' ,
'Ac' : 'f' ,
'Th' : 'f' ,
'Pa' : 'f' ,
'U' : 'f' ,
'Np' : 'f' ,
'Pu' : 'f' ,
'Am' : 'f' ,
'Cm' : 'f' ,
'Bk' : 'f' ,
'Cf' : 'f' ,
'Es' : 'f' ,
'Fm' : 'f',
'Me' : 'f',
'No' : 'f',
'Lr' : 'd',
'Rf' : 'd',
'Db' : 'd',
'Sg' : 'd',
'Bh' : 'd',
'Hs' : 'd',
'Mt' : 'd',
'Uun': 'd',
'Uuu': 'd',
'Uub': 'd' }
# Angular momentum quantum numbers
self.angularmomentum = { 's' : 0, 'p' : 1, 'd' : 2, 'f' : 3 }
self.elementweight = {
'H' : 1.0075,
'D' : 2.01410178,
'He' : 4.002,
'Li' : 6.9675,
'Be' : 9.012,
'B' : 10.8135,
'C' : 12.0106,
'N' : 14.0065,
'O' : 15.999,
'F' : 18.998,
'Ne' : 20.1797,
'Na' : 22.989,
'Mg' : 24.3050,
'Al' : 26.981,
'Si' : 28.085,
'P' : 30.973,
'S' : 32.0675,
'Cl' : 35.4515,
'Ar' : 39.948,
'K' : 39.0983,
'Ca' : 40.078,
'Sc' : 44.955,
'Ti' : 47.867,
'V' : 50.9415,
'Cr' : 51.9961,
'Mn' : 54.938,
'Fe' : 55.845,
'Co' : 58.933,
'Ni' : 58.6934,
'Cu' : 63.546,
'Zn' : 65.38,
'Ga' : 69.723,
'Ge' : 72.63,
'As' : 74.921,
'Se' : 78.96,
'Br' : 79.904,
'Kr' : 83.798,
'Rb' : 85.4678,
'Sr' : 87.62,
'Y' : 88.905,
'Zr' : 91.224,
'Nb' : 92.906,
'Mo' : 95.96,
'Tc' : 98,
'Ru' : 101.07,
'Rh' : 102.905,
'Pd' : 106.42,
'Ag' : 107.8682,
'Cd' : 112.411,
'In' : 114.818,
'Sn' : 118.710,
'Sb' : 121.760,
'Te' : 127.60,
'I' : 126.904,
'Xe' : 131.293,
'Cs' : 132.905,
'Ba' : 137.327,
'La' : 138.905,
'Ce' : 140.116,
'Pr' : 140.907,
'Nd' : 144.242,
'Pm' : 145,
'Sm' : 150.36,
'Eu' : 151.964,
'Gd' : 157.25,
'Tb' : 158.925,
'Dy' : 162.500,
'Ho' : 164.930,
'Er' : 167.259,
'Tm' : 168.934,
'Yb' : 173.054,
'Lu' : 174.9668,
'Hf' : 178.49,
'Ta' : 180.947,
'W' : 183.84,
'Re' : 186.207,
'Os' : 190.23,
'Ir' : 192.217,
'Pt' : 195.084,
'Au' : 196.966,
'Hg' : 200.59,
'Tl' : 204.3835,
'Pb' : 207.2,
'Bi' : 208.980,
'Po' : 209,
'At' : 210,
'Rn' : 222,
'Fr' : 223,
'Ra' : 226,
'Ac' : 227,
'Th' : 232.038,
'Pa' : 231.035,
'U' : 238.028,
'Np' : 237,
'Pu' : 244,
'Am' : 243,
'Cm' : 247,
'Bk' : 247,
'Cf' : 251,
'Es' : 252,
'Fm' : 257,
'Md' : 258,
'No' : 259,
'Lr' : 262,
'Rf' : 267,
'Db' : 268,
'Sg' : 271,
'Bh' : 272,
'Hs' : 270,
'Mt' : 276,
'Ds' : 281,
'Rg' : 280,
'Cn' : 285 }
# Covalent radii
self.CovalentRadius = {
'H' : 0.32 ,
'D' : 0.32 ,
'Ne' : 0.71 ,
'F' : 0.72 ,
'O' : 0.73 ,
'N' : 0.75 ,
'C' : 0.77 ,
'B' : 0.82 ,
'Be' : 0.90 ,
'He' : 0.93 ,
'Ar' : 0.98 ,
'Cl' : 0.99 ,
'S' : 1.02 ,
'P' : 1.06 ,
'Si' : 1.11 ,
'Kr' : 1.12 ,
'Br' : 1.14 ,
'Ni' : 1.15 ,
'Se' : 1.16 ,
'Co' : 1.16 ,
'Cu' : 1.17 ,
'Fe' : 1.17 ,
'Mn' : 1.17 ,
'Al' : 1.18 ,
'Cr' : 1.18 ,
'As' : 1.20 ,
'Ge' : 1.22 ,
'V' : 1.22 ,
'Li' : 1.23 ,
'Rh' : 1.25 ,
'Ru' : 1.25 ,
'Zn' : 1.25 ,
'Ga' : 1.26 ,
'Os' : 1.26 ,
'Ir' : 1.27 ,
'Tc' : 1.27 ,
'Re' : 1.28 ,
'Pd' : 1.28 ,
'W' : 1.30 ,
'Pt' : 1.30 ,
'Mo' : 1.30 ,
'Xe' : 1.31 ,
'Ti' : 1.32 ,
'I' : 1.33 ,
'Ta' : 1.34 ,
'Nb' : 1.34 ,
'Ag' : 1.34 ,
'Au' : 1.34 ,
'Te' : 1.36 ,
'Mg' : 1.36 ,
'Sn' : 1.41 ,
'Sb' : 1.41 ,
'U' : 1.42 ,
'In' : 1.44 ,
'Sc' : 1.44 ,
'Hf' : 1.44 ,
'Zr' : 1.45 ,
'At' : 1.45 ,
'Bi' : 1.46 ,
'Po' : 1.46 ,
'Pb' : 1.47 ,
'Cd' : 1.48 ,
'Tl' : 1.48 ,
'Hg' : 1.49 ,
'Na' : 1.54 ,
'Tm' : 1.56 ,
'Lu' : 1.56 ,
'Er' : 1.57 ,
'Ho' : 1.58 ,
'Dy' : 1.59 ,
'Tb' : 1.59 ,
'Gd' : 1.61 ,
'Y' : 1.62 ,
'Sm' : 1.62 ,
'Pm' : 1.63 ,
'Nd' : 1.64 ,
'Th' : 1.65 ,
'Ce' : 1.65 ,
'Pr' : 1.65 ,
'La' : 1.69 ,
'Yb' : 1.74 ,
'Ca' : 1.74 ,
'Eu' : 1.85 ,
'Pu' : 1.87 ,
'Sr' : 1.91 ,
'Ba' : 1.98 ,
'K' : 2.03 ,
'Rb' : 2.16 ,
'Cs' : 2.35
}
# Covalent radii, stolen from Jmol
self.CovalentRadius2 = {
'H' : .230,
'D' : .230,
'He' : .930,
'Li' : .680,
'Be' : .350,
'B' : .830,
'C' : .680,
'N' : .680,
'O' : .680,
'F' : .640,
'Ne' : 1.120,
'Na' : .970,
'Mg' : 1.100,
'Al' : 1.350,
'Si' : 1.200,
'P' : .750,
'S' : 1.020,
'Cl' : .990,
'Ar' : 1.570,
'K' : 1.330,
'Ca' : .990,
'Sc' : 1.440,
'Ti' : 1.470,
'V' : 1.330,
'Cr' : 1.350,
'Mn' : 1.350,
'Fe' : 1.340,
'Co' : 1.330,
'Ni' : 1.500,
'Cu' : 1.520,
'Zn' : 1.450,
'Ga' : 1.220,
'Ge' : 1.170,
'As' : 1.210,
'Se' : 1.220,
'Br' : 1.210,
'Kr' : 1.910,
'Rb' : 1.470,
'Sr' : 1.120,
'Y' : 1.780,
'Zr' : 1.560,
'Nb' : 1.480,
'Mo' : 1.470,
'Tc' : 1.350,
'Ru' : 1.400,
'Rh' : 1.450,
'Pd' : 1.500,
'Ag' : 1.590,
'Cd' : 1.690,
'In' : 1.630,
'Sn' : 1.460,
'Sb' : 1.460,
'Te' : 1.470,
'I' : 1.400,
'Xe' : 1.980,
'Cs' : 1.670,
'Ba' : 1.340,
'La' : 1.870,
'Ce' : 1.830,
'Pr' : 1.820,
'Nd' : 1.810,
'Pm' : 1.800,
'Sm' : 1.800,
'Eu' : 1.990,
'Gd' : 1.790,
'Tb' : 1.760,
'Dy' : 1.750,
'Ho' : 1.740,
'Er' : 1.730,
'Tm' : 1.720,
'Yb' : 1.940,
'Lu' : 1.720,
'Hf' : 1.570,
'Ta' : 1.430,
'W' : 1.370,
'Re' : 1.350,
'Os' : 1.370,
'Ir' : 1.320,
'Pt' : 1.500,
'Au' : 1.500,
'Hg' : 1.700,
'Tl' : 1.550,
'Pb' : 1.540,
'Bi' : 1.540,
'Po' : 1.680,
'At' : 1.700,
'Rn' : 2.400,
'Fr' : 2.000,
'Ra' : 1.900,
'Ac' : 1.880,
'Th' : 1.790,
'Pa' : 1.610,
'U' : 1.580,
'Np' : 1.550,
'Pu' : 1.530,
'Am' : 1.510,
'Cm' : 1.500,
'Bk' : 1.500,
'Cf' : 1.500,
'Es' : 1.500,
'Fm' : 1.500,
'Md' : 1.500,
'No' : 1.500,
'Lr' : 1.500,
'Rf' : 1.600,
'Db' : 1.600,
'Sg' : 1.600,
'Bh' : 1.600,
'Hs' : 1.600,
'Mt' : 1.600,
}
# Ionic radii, stolen from Jmol
self.IonicRadius = {
'H1-' : 1.540,
'Li1+' : 0.680,
'Be1+' : 0.440,
'Be2+' : 0.350,
'B1+' : 0.350,
'B3+' : 0.230,
'C4-' : 2.600,
'C4+' : 0.160,
'N3-' : 1.710,
'N1+' : 0.680,
'N3+' : 0.160,
'N5+' : 0.130,
'O2-' : 1.360,
'O1-' : 0.680,
'O1+' : 0.220,
'O6+' : 0.090,
'F1-' : 1.330,
'F7+' : 0.080,
'Ne1+' : 1.120,
'Na1+' : 0.970,
'Mg1+' : 0.820,
'Mg2+' : 0.660,
'Al3+' : 0.510,
'Si4-' : 2.710,
'Si1-' : 3.840,
'Si1+' : 0.650,
'Si4+' : 0.420,
'P3-' : 2.120,
'P3+' : 0.440,
'P5+' : 0.350,
'S2-' : 1.840,
'S2+' : 2.190,
'S4+' : 0.370,
'S6+' : 0.300,
'Cl1-' : 1.810,
'Cl4+' : 0.340,
'Cl7+' : 0.270,
'Ar1+' : 1.540,
'K1+' : 1.330,
'Ca1+' : 1.180,
'Ca2+' : 0.990,
'Sc3+' : 0.732,
'Ti1+' : 0.960,
'Ti2+' : 0.940,
'Ti3+' : 0.760,
'Ti4+' : 0.680,
'V2+' : 0.880,
'V3+' : 0.740,
'V4+' : 0.630,
'V5+' : 0.590,
'Cr1+' : 0.810,