- 单细胞转录组基础分析一：分析环境搭建
- 单细胞转录组基础分析二：数据质控与标准化
- 单细胞转录组基础分析三：降维与聚类
- 单细胞转录组基础分析四：细胞类型鉴定
- 单细胞转录组基础分析五：细胞再聚类
- 单细胞转录组基础分析六：伪时间分析
- 单细胞转录组基础分析七：差异基因富集分析
- 单细胞转录组基础分析八：可视化工具总结
- 单细胞数据标准化及高变基因鉴定
- 单细胞 PCA 降维结果理解
- 超越代码 5：细胞类型注释
- 超越代码 6：肿瘤细胞 CNV 分析
- 超越代码 10：细胞互作分析
- 面向初学者的单细胞详解
- 单细胞测序研究应用及分析思路笔记 （单细胞团队 南开大学 孙宝发老师团队）
- 单细胞转录组高级分析一：多样本合并与批次校正
- 单细胞转录组高级分析二：转录调控网络分析
- 单细胞转录组高级分析三：细胞通讯分析
- 单细胞转录组高级分析四：scRNA 数据推断 CNV
- 单细胞转录组高级分析五：GSEA 与 GSVA 分析
- 单细胞转录组高级分析六：TCGA 生存分析
- 单细胞转录组高级分析七：整合 scATAC 数据
- 单细胞转录组高级分析八：整合 V (D) J 数据
- 细胞通讯研究的最新思路
- 单细胞工具 MARVEL— 单细胞可变剪切分析 (一)
- 单细胞工具 MARVEL— 单细胞可变剪切分析 (二)
- cellDancer 预测 RNA Velocity 和单细胞水平的 RNA 动力学速率
- Nature | 通过网络推理和计算机基因扰动分析细胞身份
- Cell Type Classification Methods - Google 表格
- 哈佛大学单细胞课程 | 笔记汇总 （一）
- 哈佛大学单细胞课程 | 笔记汇总 （二）
- 哈佛大学单细胞课程 | 笔记汇总 （三）
- 哈佛大学单细胞课程 | 笔记汇总 （四）
- 哈佛大学单细胞课程 | 笔记汇总 （五）
- 哈佛大学单细胞课程 | 笔记汇总 （六）
- 哈佛大学单细胞课程 | 笔记汇总 （七）
- 哈佛大学单细胞课程 | 笔记汇总 （八）
- 哈佛大学单细胞课程 | 笔记汇总 （九）
- Single-cell best practices — Single-cell best practices
- hbctraining/scRNA-seq_online: Single-cell RNA-seq data analysis workshop
- 单细胞测序 Q&A 之数据预处理
- 单细胞笔记系列 | 1 - 单细胞测序简介
- 一文打通单细胞上游：从软件部署到上游分析
- 单细胞测序 Q&A 之细胞分群与鉴定
- 张泽民老师系列文章解读 - 综述篇
- 注释单细胞数据集的小妙招！
- 单细胞转录组做代谢分析的方法汇总
- 别再纠结捕获多少细胞做多少重复了！答案在这里 | 单细胞专题
- scanpy官方教程2022|02-细胞发育/分化轨迹推断
- 盘点：也适用于单细胞的降维和聚类方法，值得收藏
- 单细胞分析如何确定合适的 resolution
- 单细胞测序专题 | monocle2 拟时序分析前后结果不一致？带您认识一款新的分析软件 PAGA
- 单细胞教程【1】单细胞转录组 -- 基础篇（更新）
- 单细胞教程【2】单细胞转录组系列 - CellRanger
- 单细胞层面的表达量差异分析到底如何做
- SingCellaR 代码实操（一）：PBMCs 的标准流程
- 关于什么是单细胞测序的知识整理，ChatGPT 会做的更好吗？
- 单细胞多组学 ATAC-Cellranger ARC - 结果解读之概述
- 单细胞多组学 ATAC-Cellranger ARC - 结果解读之网页报告
- 如何把控数据质控那个 “度”？
- 单细胞多组学数据分析最佳实践 (2023 典藏版)
- 单细胞转录组经典聚类算法：Louvain 与 Leiden
- 单细胞 —— 从降维聚类分群、细胞命名、到批量富集分析，一文打通 GSE104154 博来霉素小鼠模型单细胞数据
- cellchat 细胞通讯中 prob 与 pval 的含义是什么？
- 5 种方式美化你的单细胞 umap 散点图
- 空间转录组这么火，何不一起入个门
- Nature Methods | 空间转录组与单细胞转录组整合分析工具性能测试 - 知乎
- 空间转录组分析工具篇 4：stLearn（上）
- 三维和空间基因组学时代（下篇）
- 时空通讯分析导论
- 空间转录组分析工具篇 3：Scanpy
- 空间转录组的绝对干货！还不来收藏？
- 空间转录组差异及富集分析应用思路
- 空间转录组分析工具篇 4：stLearn（下）
- 空间转录组分析工具篇 5：DR.SC
- 空间转录组定量分析及应用 — 基因调控网络
- 空间转录组学的分析技术都有哪些？ - 知乎
- 空间转录组分析工具篇 6：SPOTLight
- 空间转录组数据分析策略之定位分析
- 空间转录组聚类分析与生态位
- Cancer Cell 专家论坛 | 肿瘤空间转录组学
- 单细胞及空间转录组整合分析方法
- 空间转录组应用解析 —— 微环境解析
- 空间转录组可以解决哪些肿瘤研究难题？
- 理想的空间技术 -- 真正的单细胞分辨率
- Visium HD 分析 || 首篇 10xVisium HD 分析：解析结直肠癌和癌旁样本
- 跟着 Seurat 官网学 Xenium 空转分析
- 代码来袭！在 R 和 Seurat 中导入 BD Rhapsody 单细胞多组学数据
- 【好物分享】Seurat 在线细胞注释工具：Azimuth
- Cell 在用的单细胞代谢预测工具：Compass
- 单细胞研究肿瘤专题 ———— 细胞图谱绘制研究肿瘤异质性
- Seurat V5 | 构建单细胞多模态数据整合的统一场论
- 10X enclone 来确定 clonetype
- 单细胞差异分析之 pseudobulk 的 3 种实现方法
- 介绍一种简单可行的 V4 的 Seruat 安装方案
- Seurat 4 与 5 共存
- 学正宗的空间单细胞就得跟着 10x 官网
- SCTransform 真的能完美替代 Seurat 早期的 3 个函数吗
- scanpy 和 seurat 的所有 Marker 基因可视化方法帮你打包好啦
- Monocle 3 beta： 最新升级版的单细胞转录组拟时序分析利器 赶快来看吧
- 巧用 InferCNV，探索肿瘤复杂遗传结构的显微镜
- 拟时序的正确姿势（拟时序一本通 02）
- 动态确定线粒体过滤阈值筛选细胞
- 简单几步构建一个单细胞转录组浏览器
- 超越代码 3：单细胞数据质控
- 联川生物 2024 版 10x 单细胞转录组分析报告重磅发布
- SCENIC 寻找转录调控因子太慢了？那就试试这个 NC 新方法 scRegClust
- 单细胞思路 | 第 2 期 单细胞中的资源库
- R 包 | CellChat 进行单细胞组学分析中的细胞通讯分析
- 【总览】各类免疫细胞表型概述
- 单细胞转录组 | 髓系细胞大类注释及亚群细分总结
- 最全！免疫检查点图文详解（上）
- 看透一个免疫细胞：B cell