diff --git a/.gitignore b/.gitignore index 8eb0cd09..98019b4e 100644 --- a/.gitignore +++ b/.gitignore @@ -8,6 +8,9 @@ coverage.lcov # Environment variables .env +# Local favicon +/frontend/favicon.ico + # Created by https://www.toptal.com/developers/gitignore/api/visualstudiocode,pycharm,vim,emacs # Edit at https://www.toptal.com/developers/gitignore?templates=visualstudiocode,pycharm,vim,emacs diff --git a/frontend/src/api/__tests__/utils.spec.ts b/frontend/src/api/__tests__/utils.spec.ts index 74fc9d24..7854379b 100644 --- a/frontend/src/api/__tests__/utils.spec.ts +++ b/frontend/src/api/__tests__/utils.spec.ts @@ -36,17 +36,18 @@ describe('roundIt method', () => { describe('search method', () => { it('should return route location if match', () => { - const result = search('BRCA1') + const result = search('BRCA1', 'ghcr37') expect(result).toEqual({ name: 'gene', params: { - searchTerm: 'BRCA1' + searchTerm: 'BRCA1', + genomeRelease: 'ghcr37' } }) }) it.skip('should return null if no match', () => { - const result = search('foo') + const result = search('foo', 'foo37') expect(result).toBe(null) }) }) diff --git a/frontend/src/api/common.ts b/frontend/src/api/common.ts index c3212660..d98219e9 100644 --- a/frontend/src/api/common.ts +++ b/frontend/src/api/common.ts @@ -1,3 +1,5 @@ +export const API_BASE_PREFIX = import.meta.env.MODE == 'development' ? '//localhost:8080/' : '/' + export const API_BASE_PREFIX_ANNONARS = import.meta.env.MODE == 'development' ? '//localhost:8080/proxy/annonars' : '/proxy/annonars' diff --git a/frontend/src/api/misc.ts b/frontend/src/api/misc.ts index 6911733c..dac0d2fa 100644 --- a/frontend/src/api/misc.ts +++ b/frontend/src/api/misc.ts @@ -1,6 +1,6 @@ -import { API_BASE_PREFIX_ANNONARS } from '@/api/common' +import { API_BASE_PREFIX } from '@/api/common' -const API_BASE_URL = API_BASE_PREFIX_ANNONARS +const API_BASE_URL = API_BASE_PREFIX export class MiscClient { private apiBaseUrl: string diff --git a/frontend/src/assets/reev-logo_old.svg b/frontend/src/assets/reev-logo_old.svg deleted file mode 100644 index 1651dd6b..00000000 --- a/frontend/src/assets/reev-logo_old.svg +++ /dev/null @@ -1,2296 +0,0 @@ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 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+ { #logo { margin-left: 25px; margin-top: 10px; + margin-bottom: 10px; } diff --git a/frontend/src/components/VariantDetails/VariantTools.vue b/frontend/src/components/VariantDetails/VariantTools.vue index 1fb2baf6..e5ea7322 100644 --- a/frontend/src/components/VariantDetails/VariantTools.vue +++ b/frontend/src/components/VariantDetails/VariantTools.vue @@ -433,7 +433,7 @@ const jumpToLocus = async () => { FATHMM -