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<!DOCTYPE html>
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head>
<meta charset="utf-8" />
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
<meta name="generator" content="pandoc" />
<title></title>
<script src="site_libs/jquery-1.11.3/jquery.min.js"></script>
<meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1" />
<link href="site_libs/bootstrap-3.3.5/css/cosmo.min.css" rel="stylesheet" />
<script src="site_libs/bootstrap-3.3.5/js/bootstrap.min.js"></script>
<script src="site_libs/bootstrap-3.3.5/shim/html5shiv.min.js"></script>
<script src="site_libs/bootstrap-3.3.5/shim/respond.min.js"></script>
<script src="site_libs/navigation-1.1/tabsets.js"></script>
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<script src="site_libs/highlightjs-9.12.0/highlight.js"></script>
<link rel="icon" type="image/png" href="images/favicon.png" />
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<script>
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</script>
<style type="text/css">code{white-space: pre;}</style>
<style type="text/css">
pre:not([class]) {
background-color: white;
}
</style>
<script type="text/javascript">
if (window.hljs) {
hljs.configure({languages: []});
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if (document.readyState && document.readyState === "complete") {
window.setTimeout(function() { hljs.initHighlighting(); }, 0);
}
}
</script>
<style type="text/css">
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font-size: 34px;
}
h1.title {
font-size: 38px;
}
h2 {
font-size: 30px;
}
h3 {
font-size: 24px;
}
h4 {
font-size: 18px;
}
h5 {
font-size: 16px;
}
h6 {
font-size: 12px;
}
.table th:not([align]) {
text-align: left;
}
</style>
<link rel="stylesheet" href="css/site.css" type="text/css" />
</head>
<body>
<style type = "text/css">
.main-container {
max-width: 940px;
margin-left: auto;
margin-right: auto;
}
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color: inherit;
background-color: rgba(0, 0, 0, 0.04);
}
img {
max-width:100%;
height: auto;
}
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padding-top: 12px;
}
button.code-folding-btn:focus {
outline: none;
}
</style>
<div class="container-fluid main-container">
<!-- tabsets -->
<script>
$(document).ready(function () {
window.buildTabsets("TOC");
});
</script>
<!-- code folding -->
<div id="rStudioHeader" class="alwaysShrunk">
<div class="innards bandContent">
<div>
<a class="productName" href="index.html">Kevin Caye</a>
<div class="rStudio"><span class="light"> </span> <a href="https://www.r-project.org/"><div class="logo"></div></a> enthusiast.</div>
</div>
<div id="menu">
<div id="menuToggler"></div>
<div id="menuItems">
<a class="menuItem" href="CV.html">Vitae</a>
<a class="menuItem" href="publications.html">Publications</a>
<a class="menuItem" href="software.html">Software</a>
<a class="menuItem" href="teaching.html">Teaching</a>
<a class="menuItem" href="slides.html">Talks</a>
<!-- <a class="menuItem" href="https://cayek.github.io/blog/">Blog</a> -->
<a class="menuItem" href="about.html">About</a>
<a class="menuItem gitHub" href="https://github.com/cayek/cayek.github.io"></a>
<a class="menuItem gitHubText" href="https://github.com/cayek/cayek.github.io">Source on GitHub</a>
</div>
</div>
</div>
</div>
<style type="text/css">
#TOC {
margin-left: 35px;
margin-top: 90px;
}
</style>
<script type="text/javascript">
$(".main-container").removeClass("main-container").removeClass("container-fluid").addClass("footerPushDown");
</script>
<div id="pageContent" class="standardPadding">
<div class="articleBandContent">
<div class="fluid-row" id="header">
</div>
<div id="kevin-caye" class="section level1">
<h1>Kevin Caye</h1>
<hr />
<blockquote>
<p>Computer Science - Statistics - Machine Learning Optimization - Data Visualization - Operational Research</p>
</blockquote>
<hr />
<div id="competences" class="section level2">
<h2>Compétences</h2>
<dl>
<dt>Informatique</dt>
<dd><strong>Programmation :</strong> R, python, C/C++, SQL.
</dd>
<dd><strong>OS :</strong> Linux, OS X, Windows.
</dd>
<dd><strong>Outils :</strong> Emacs, Org mode, Git, RStudio, Jupyter, Docker, Méthodologie Agile.
</dd>
<dt>Maths</dt>
<dd>Optimisation, Statistiques, Modélisation Probabiliste, Apprentissage Automatique, Recherche Opérationnelle.
</dd>
<dt>Langues</dt>
<dd><strong>Anglais :</strong> bon niveau (lu, écrit, parlé).
</dd>
<dd><strong>Espagnol :</strong> niveau moyen (lu, écrit, parlé).
</dd>
</dl>
</div>
<div id="formation" class="section level2">
<h2>Formation</h2>
<dl>
<dt>2014-oct. 2017</dt>
<dd><p><strong>Thèse en mathématiques appliquées</strong>; TIMC-IMAG, La Tronche (38) et Gipsa-lab, Saint Martin D’hères (38)</p>
<p><em>Méthodes de factorisation matricielle pour la génomique des populations et les tests d’association</em></p>
</dd>
<dt>2011-2014</dt>
<dd><p><strong>Diplôme d’ingénieur en informatique et mathématiques appliquées</strong>; Grenoble-INP, ENSIMAG, Saint-Martin D’Heres (38)</p>
<p><em>Filière : MMIS (Modélisation Mathématique, Image et Simulation)</em></p>
</dd>
<dt>2008-2011</dt>
<dd><strong>Classe préparatoire MPSI/MP*</strong>; lycée Albert schweitzer, Le Raincy (93)
</dd>
</dl>
</div>
<div id="experiences-professionnelles" class="section level2">
<h2>Expériences professionnelles</h2>
<dl>
<dt>2017-nov. Aujourd’hui</dt>
<dd><strong>Prestataire de service</strong>; Kaizen Solutions, Meylan (38). Ma mission se déroule au sein de l’équipe de recherche et développement “Analytics Applications and Programs” de Schneider Electric. Cette équipe est en charge du développement d’algorithmes et de programmes pour l’analyse de données (consommation énergétique de bâtiments, détection de fautes sur des équipements électriques, …).
</dd>
<dt>2014-oct. 2017</dt>
<dd><strong>Thèse en mathématiques appliquées.</strong> Les manières de représenter la santé et le vivant ont considérablement changé durant ces dernières années. Ces nouvelles représentations sont basées sur la collecte de données massives, et plus particulièrement de données épidémiologiques, démographiques et biologiques issues de plates-formes à haut débit. L’objectif de cette thèse est de développer des méthodes permettant de détecter des signatures d’association entre variables dans de telles données. Nous nous intéressons notamment aux modèles basées sur des problèmes d’optimisation faisant intervenir des factorisations matricielles.
</dd>
<dt>2014-2016</dt>
<dd><strong>Enseignement.</strong> Deux ans de monitorat :
</dd>
<dd><ul>
<li>TP de découverte des mathématiques appliquées en L1 à l’UGA</li>
<li>TD de soutien de mathématiques en L1 à l’UGA</li>
<li>Cours/TP de modélisation de la dynamique en biologie en L1 à l’UGA</li>
<li>Encadrement de projet de science des données en M1 à l’ENSIMAG</li>
</ul>
</dd>
<dt>Février-Août 2014</dt>
<dd><strong>Stage recherche et développement</strong>; Dassault Systèmes, Vélizy-Villacoublay (78). Dans le département <em>Science and Corporate Research</em>, le stage consistait à faire un état de l’art des méthodes de simulation 3D basées sur des exemples. Par la suite un prototype a été implémenté à l’aide d’OpenGL et C++.
</dd>
<dt>Juillet-Août 2013</dt>
<dd><strong>Stage ingénieur R&D </strong>; INRIA, Montbonnot (38). Dans l’équipe MAVERICK, le stage consistait à implémenter des techniques de rendu 3D à l’aide de la bibliothèque Gigavoxel (C++, GLSL, CUDA).
</dd>
</dl>
</div>
<div id="publications" class="section level2">
<h2>Publications</h2>
<p><strong>Fast Inference of Individual Admixture Coefficients Using Geographic Data</strong><br />
Kevin Caye, Flora Jay, Olivier Michel, Olivier François<br />
<em>The Annals of Applied Statistics</em></p>
<p><strong>Identifying outlier loci in admixed and in continuous populations using ancestral population differentiation statistics</strong><br />
Helena Martins, Kevin Caye, Keurcien Luu, Michael GB Blum, Olivier François<br />
<em>bioRxiv</em>; doi: <a href="http://dx.doi.org/10.1101/054585">10.1101/054585</a></p>
<p><strong>TESS3: fast inference of spatial population structure and genome scans for selection</strong><br />
Kevin Caye, Timo M. Deist, Helena Martins, Olivier François<br />
<em>Molecular ecology resources</em>, 2016, vol. 16, no 2, p. 540-548; doi: <a href="http://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.12471">10.1111/1755-0998.12471</a></p>
</div>
<div id="centres-dinteret" class="section level2">
<h2>Centres d’intérêt</h2>
<dl>
<dt>Sports</dt>
<dd>Karaté Kyokushin en compétition, raid multipsort par équipe en compétition et sport de montagne (ski, randonnées, trekking, trail).
</dd>
<dt>Autres</dt>
<dd>Participation à des concours de mathématiques appliquées.
</dd>
</dl>
</div>
<div id="references" class="section level2">
<h2>Références</h2>
<ul>
<li><p><a href="http://membres-timc.imag.fr/Olivier.Francois/">Olivier Francois</a>, maître de conférence rattaché à l’ENSIMAG et au laboratoire TIMC-IMAG (La Tronche, France)</p></li>
<li><p><a href="http://membres-timc.imag.fr/Michael.Blum/">Michael Blum</a>, directeur de recherche CNRS rattaché au laboratoire TIMC-IMAG et responsable de l’équipe BCM (La Tronche, France)</p></li>
</ul>
<!-- * [Everton Hermann](https://www.linkedin.com/in/everton-hermann-59908a6/), ingénieur de recherche à Dassault Systèmes (Vélizy-Villacoublay, France) -->
<hr />
<blockquote>
<p><a href="mailto:[email protected]">[email protected]</a> • +33 6 19 45 11 46 • 26 ans<br />
18 rue du pont prouiller - La Tronche 38700, France<br />
<a href="https://cayek.github.io/" class="uri">https://cayek.github.io/</a></p>
</blockquote>
</div>
</div>
</div> <!-- articleBandContent -->
</div> <!-- pageContent -->
<div id="rStudioFooter" class="band full">
<div class="bandContent">
<div id="copyright">Powered by <a href="http://rmarkdown.rstudio.com/rmarkdown_websites.html">Rmarkdown. </a> </div>
<div id="logos">
<a href="https://twitter.com/kevincaye" class="footerLogo twitter"></a>
<a href="https://github.com/cayek" class="footerLogo gitHub"></a>
<a href="https://www.linkedin.com/in/kevin-caye-0a865a6a" class="footerLogo linkedIn"></a>
</div>
</div>
</div>
</div>
<script>
// add bootstrap table styles to pandoc tables
function bootstrapStylePandocTables() {
$('tr.header').parent('thead').parent('table').addClass('table table-condensed');
}
$(document).ready(function () {
bootstrapStylePandocTables();
});
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</html>