error_check.py

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    Copyright 2017 

    This file is part of Algo LSTM.
    
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# Written by Tim Ioannidis   
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########## This script handles error checking  #############
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# import std modules
import pybel, glob, os, re, argparse, sys, random, time
from Scripts.globalvars import *
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### function to print available geometries ###
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def check_file_exists(file):
    # read from csv
    return os.path.isfile(file)

def check_file_exists_fatal(file):
    if not check_file_exists(file):
        msg = '\nFile ' + file + ' does not exist. Exiting..\n'
        print_msg(msg)
        time.sleep(3)
        sys.exit()
    else:
        return True

def check_dir_exists_fatal(model_dir):
    if not os.path.isdir(model_dir):
        msg = '\nDirectory ' + model_dir + ' does not exist. Exiting..\n'
        print_msg(msg)
        time.sleep(3)
        sys.exit()
    else:
        return True