sistemas.tex

\chapter{Sistemas evaluados} \label{sistemas}

Algunas de las propiedades de los sistemas que pueden ser relevantes para la evaluación de la 

Dado que solo se evalúan interacciones de no-unión, los sistemas biológicos de mayor interés no pueden ser utilizados.
Para de
Una vez asignados los tipos a todos los elementos, se realizó una ejecución inicial usando el paquete de software Amber. 
Este es un proceso usual que se utiliza en la simulación mediante dinámica molecular y tiene como finalidad asociar el sistema a una tempreatura definida por el usuario, 
es decir, a una distribución inicial de velocidades de las partículas.

Para las pruebas se utilizaron tres tamaños distintos de sistema:

Un sistemas de 200 partículas, contenido inicialmente en una caja de 20\AA x 20\AA

Un sistemas de 8000 partículas, contenido inicialmente en una caja de 70\AA x 70\AA

Un sistema de 30000 partículas, contenido inicialmente en una caja de 100\AA x 100\AA