Makefile

#
# Makefile for Yet Another Pulsar Processor
#
# Created by Jayanth Chennamangalam on 2008.11.17
#

# C compiler and flags
# this may need to be changed to g77 in some cases
CC = gcc

# include path for other libraries
ifeq ($(shell uname), Darwin)
CFLAGS_INC_PGPLOT =-I/opt/local/include# define if needed (as -I[...])
else
CFLAGS_INC_PGPLOT =# define if needed (as -I[...])
endif
CFLAGS_INC_FFTW3 =# define if needed (as -I[...])
CFLAGS_INC_HDF5 =-I/usr/local/hdf5/include
ifeq ($(shell uname), Darwin)
CFLAGS_INC_CFITSIO =-I/opt/local/include# define if needed (as -I[...])
else
CFLAGS_INC_CFITSIO =# define if needed (as -I[...])
endif

CFLAGS = -std=gnu99 -pedantic -Wall $(CFLAGS_INC_PGPLOT) $(CFLAGS_INC_FFTW3)  \
	$(CFLAGS_INC_CFITSIO)
ifeq ($(HDF5), yes)
CFLAGS += $(CFLAGS_INC_HDF5)
endif
CFLAGS_C_DEBUG = $(CFLAGS) -g -c
CFLAGS_C_RELEASE = $(CFLAGS) -O3 -c
ifeq ($(DEBUG), yes)
CFLAGS_C = $(CFLAGS_C_DEBUG)
else
CFLAGS_C = $(CFLAGS_C_RELEASE)
endif
CFLAGS_L_DEBUG = $(CFLAGS) -g
CFLAGS_L_RELEASE = $(CFLAGS) -O3
ifeq ($(DEBUG), yes)
CFLAGS_L = $(CFLAGS_L_DEBUG)
else
CFLAGS_L = $(CFLAGS_L_RELEASE)
endif

# enable/disable HDF5 compilation
ifeq ($(HDF5), yes)
DHDF5 = -DHDF5
endif

# enable/disable the debug flag
ifeq ($(DEBUG), yes)
DDEBUG = -DDEBUG
endif

# linker flags
ifeq ($(shell uname), Darwin)
LFLAGS_PGPLOT_DIR =-L/opt/local/lib# define if not in $PATH (as -L[...])
else
LFLAGS_PGPLOT_DIR =# define if not in $PATH (as -L[...])
endif
LFLAGS_FFTW3_DIR =# define if not in $PATH (as -L[...])
ifeq ($(HDF5), yes)
LFLAGS_HDF5_DIR =-L/usr/local/hdf5/lib
endif
ifeq ($(shell uname), Darwin)
LFLAGS_CFITSIO_DIR =-L/opt/local/lib# define if not in $PATH (as -L[...])
else
LFLAGS_CFITSIO_DIR =# define if not in $PATH (as -L[...])
endif
LFLAGS_FFTW3 = $(LFLAGS_FFTW3_DIR) -lfftw3f
LFLAGS_CFITSIO = $(LFLAGS_CFITSIO_DIR) -lcfitsio
ifeq ($(HDF5), yes)
LFLAGS_HDF5 = $(LFLAGS_HDF5_DIR) -lhdf5
endif
# in some cases, linking needs to be done with the X11 library, in which case
# append '-lX11' (and possibly the path to the library) to the line below, as
# shown in the commented out example. the commented example also shows other
# libraries that may be needed.
# libgfortran may also be needed in some cases, in which case append
# '-lgfortran' (and possibly the path to the library) to the line below.
LFLAGS_PGPLOT = $(LFLAGS_PGPLOT_DIR) -lcpgplot
#LFLAGS_PGPLOT = $(LFLAGS_PGPLOT_DIR) -lpgplot -lcpgplot -lX11 -lpng
LFLAGS_MATH = -lm

# directories
SRCDIR = src
SCRIPTDIR = scripts
UTILDIR = utilities
MANDIR = man
IDIR = src
BINDIR = bin
# binary installation directory - modify if needed
BININSTALLDIR = /usr/local/bin
# man page installation directory - modify if needed
MANINSTALLDIR = /usr/local/share/man/man1

# command definitions
DELCMD = rm

all: yapp_makever \
	 yapp_version.o \
	 yapp_erflookup.o \
	 yapp_common.o \
	 yapp_viewmetadata.o \
	 yapp_viewmetadata \
	 colourmap.o \
	 yapp_showinfo.o \
	 yapp_showinfo \
	 yapp_viewdata.o \
	 yapp_viewdata \
	 yapp_ft.o \
	 yapp_ft \
	 yapp_dedisperse.o \
	 yapp_dedisperse \
	 yapp_smooth.o \
	 yapp_smooth \
	 yapp_decimate.o \
	 yapp_decimate \
	 yapp_filter.o \
	 yapp_filter \
	 yapp_fold.o \
	 yapp_fold \
	 yapp_add.o \
	 yapp_add \
	 yapp_fits2fil.o \
	 yapp_fits2fil \
	 yapp_dat2tim.o \
	 yapp_dat2tim \
	 yapp_tim2dat.o \
	 yapp_tim2dat \
	 yapp_fil2h5.o \
	 yapp_fil2h5 \
	 yapp_subtract.o \
	 yapp_subtract \
	 yapp_siftpulses.o \
	 yapp_siftpulses \
	 yapp_stacktim.o \
	 yapp_stacktim \
	 yapp_split.o \
	 yapp_split \
	 yapp_ym2fil.o \
	 yapp_ym2fil \

yapp_makever: $(SRCDIR)/yapp_makever.c
	$(CC) $(CFLAGS_L) $< -o $(IDIR)/$@
	$(IDIR)/$@
	$(DELCMD) $(IDIR)/$@

yapp_version.o: $(SRCDIR)/yapp_version.c
	$(CC) $(CFLAGS_C) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_erflookup.o: $(SRCDIR)/yapp_erflookup.c $(SRCDIR)/yapp.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_common.o: $(SRCDIR)/yapp_common.c $(SRCDIR)/yapp.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_viewmetadata.o: $(SRCDIR)/yapp_viewmetadata.c $(SRCDIR)/yapp.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_viewmetadata: $(IDIR)/yapp_viewmetadata.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

colourmap.o: $(SRCDIR)/colourmap.c $(SRCDIR)/colourmap.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_showinfo.o: $(SRCDIR)/yapp_showinfo.c $(SRCDIR)/yapp.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_showinfo: $(IDIR)/yapp_showinfo.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o $(IDIR)/colourmap.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_viewdata.o: $(SRCDIR)/yapp_viewdata.c $(SRCDIR)/yapp.h \
	$(SRCDIR)/yapp_erflookup.c
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_viewdata: $(IDIR)/yapp_viewdata.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o $(IDIR)/colourmap.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_ft.o: $(SRCDIR)/yapp_ft.c $(SRCDIR)/yapp.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_ft: $(IDIR)/yapp_ft.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_FFTW3) \
		$(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_dedisperse.o: $(SRCDIR)/yapp_dedisperse.c $(SRCDIR)/yapp.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $(DFC) $(SRCDIR)/yapp_dedisperse.c \
		-o $(IDIR)/$@

yapp_dedisperse: $(IDIR)/yapp_dedisperse.o
	$(CC) $(IDIR)/yapp_dedisperse.o $(IDIR)/yapp_version.o \
		$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o $(IDIR)/colourmap.o \
		$(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_smooth.o: $(SRCDIR)/yapp_smooth.c $(SRCDIR)/yapp.h \
	$(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_smooth: $(IDIR)/yapp_smooth.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_decimate.o: $(SRCDIR)/yapp_decimate.c $(SRCDIR)/yapp.h \
	$(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_decimate: $(IDIR)/yapp_decimate.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_filter.o: $(SRCDIR)/yapp_filter.c $(SRCDIR)/yapp.h \
	$(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_filter: $(IDIR)/yapp_filter.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_FFTW3) \
		$(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_fold.o: $(SRCDIR)/yapp_fold.c $(SRCDIR)/yapp.h $(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_fold: $(IDIR)/yapp_fold.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o $(IDIR)/colourmap.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_add.o: $(SRCDIR)/yapp_add.c $(SRCDIR)/yapp.h $(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_add: $(IDIR)/yapp_add.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_subtract.o: $(SRCDIR)/yapp_subtract.c $(SRCDIR)/yapp.h $(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_subtract: $(IDIR)/yapp_subtract.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_fits2fil.o: $(UTILDIR)/yapp_fits2fil.c $(UTILDIR)/yapp_fits2fil.h \
	$(SRCDIR)/yapp.h $(SRCDIR)/yapp_sigproc.h $(SRCDIR)/yapp_psrfits.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) -I$(SRCDIR) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(UTILDIR)/$@

yapp_fits2fil: $(UTILDIR)/yapp_fits2fil.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_dat2tim.o: $(UTILDIR)/yapp_dat2tim.c $(UTILDIR)/yapp_dat2tim.h \
	$(SRCDIR)/yapp.h $(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) -I$(SRCDIR) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(UTILDIR)/$@

yapp_dat2tim: $(UTILDIR)/yapp_dat2tim.o $(SRCDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_tim2dat.o: $(UTILDIR)/yapp_tim2dat.c $(UTILDIR)/yapp_tim2dat.h \
	$(SRCDIR)/yapp.h $(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) -I$(SRCDIR) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(UTILDIR)/$@

yapp_tim2dat: $(UTILDIR)/yapp_tim2dat.o $(SRCDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

ifeq ($(HDF5), yes)
yapp_fil2h5.o: $(UTILDIR)/yapp_fil2h5.c $(UTILDIR)/yapp_fil2h5.h \
	$(SRCDIR)/yapp.h $(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) -I$(SRCDIR) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(UTILDIR)/$@
else
yapp_fil2h5.o:
	@echo "WARNING: yapp_fil2h5.o will not be compiled (HDF5=no)"
endif

ifeq ($(HDF5), yes)
yapp_fil2h5: $(UTILDIR)/yapp_fil2h5.o $(SRCDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@
else
yapp_fil2h5:
	@echo "WARNING: yapp_fil2h5 will not be compiled (HDF5=no)"
endif

yapp_siftpulses.o: $(SRCDIR)/yapp_siftpulses.c $(SRCDIR)/yapp.h $(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_siftpulses: $(IDIR)/yapp_siftpulses.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_stacktim.o: $(SRCDIR)/yapp_stacktim.c $(SRCDIR)/yapp.h $(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_stacktim: $(IDIR)/yapp_stacktim.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o $(IDIR)/colourmap.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_split.o: $(SRCDIR)/yapp_split.c $(SRCDIR)/yapp.h $(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(IDIR)/$@

yapp_split: $(IDIR)/yapp_split.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o $(IDIR)/colourmap.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

yapp_ym2fil.o: $(UTILDIR)/yapp_ym2fil.c $(SRCDIR)/yapp.h $(SRCDIR)/yapp_sigproc.h
	$(CC) $(CFLAGS_C) -I$(SRCDIR) $(DDEBUG) $(DHDF5) $< -o $(UTILDIR)/$@

yapp_ym2fil: $(UTILDIR)/yapp_ym2fil.o $(IDIR)/yapp_version.o \
	$(IDIR)/yapp_erflookup.o $(IDIR)/yapp_common.o $(IDIR)/colourmap.o
	$(CC) $^ $(LFLAGS_PGPLOT) $(LFLAGS_MATH) $(LFLAGS_CFITSIO) $(LFLAGS_HDF5) -o $(BINDIR)/$@

# install the man pages
install:
	@echo Copying binaries...
	cp $(BINDIR)/* $(BININSTALLDIR)
	@echo DONE
	@echo Copying scripts...
	cp $(SCRIPTDIR)/* $(BININSTALLDIR)
	@echo DONE
	@echo Copying man pages...
	mkdir -p $(MANINSTALLDIR)
	cp $(MANDIR)/*.1 $(MANINSTALLDIR)
	@echo DONE

clean:
	$(DELCMD) $(SRCDIR)/yapp_version.c
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_version.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_erflookup.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_common.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_viewmetadata.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/colourmap.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_showinfo.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_viewdata.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_ft.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_dedisperse.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_smooth.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_decimate.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_filter.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_fold.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_add.o
	$(DELCMD) $(UTILDIR)/yapp_fits2fil.o
	$(DELCMD) $(UTILDIR)/yapp_dat2tim.o
	$(DELCMD) $(UTILDIR)/yapp_tim2dat.o
ifeq ($(HDF5), yes)
	$(DELCMD) $(UTILDIR)/yapp_fil2h5.o
endif
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_subtract.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_siftpulses.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_stacktim.o
	$(DELCMD) $(IDIR)/yapp_split.o
	$(DELCMD) $(UTILDIR)/yapp_ym2fil.o