miRSecStructure.txt

>hsa-let-7a-1
UGGGAUGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUUUUAGGGUCACACCCACCACUGGGAGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCUA
(((((.(((((((((((((((((((((.....(((...((((....)))).))))))))))))))))))))))))))))) (-34.20)
>hsa-let-7a-2
AGGUUGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUUUAGAAUUACAUCAAGGGAGAUAACUGUACAGCCUCCUAGCUUUCCU
(((..(((.(((.(((((((((((((.........(((......)))))))))))))))).))).))).))) (-25.20)
>hsa-let-7a-3
GGGUGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUUUGGGGCUCUGCCCUGCUAUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU
(((.(((((((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))))))).))) (-34.10)
>hsa-let-7b
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>hsa-let-7c
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>hsa-let-7d
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>hsa-let-7e
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>hsa-let-7f-1
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>hsa-let-7f-2
UGUGGGAUGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUUUUAGGGUCAUACCCCAUCUUGGAGAUAACUAUACAGUCUACUGUCUUUCCCACG
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>hsa-mir-15a
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>hsa-mir-16-1
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>hsa-mir-17
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>hsa-mir-18a
UGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCA
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>hsa-mir-19a
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>hsa-mir-19b-1
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>hsa-mir-19b-2
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>hsa-mir-20a
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>hsa-mir-21
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>hsa-mir-22
GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCUGACCCAGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC
(((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).))) (-39.80)
>hsa-mir-23a
GGCCGGCUGGGGUUCCUGGGGAUGGGAUUUGCUUCCUGUCACAAAUCACAUUGCCAGGGAUUUCCAACCGACC
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>hsa-mir-24-1
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>hsa-mir-24-2
CUCUGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGGUUUGUGUACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGG
(((((..(((.((....(((((((((..((((((.....))))))....)))))))))...)).))).))))) (-26.00)
>hsa-mir-25
GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC
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>hsa-mir-26a-1
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>hsa-mir-26b
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>hsa-mir-27a
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>hsa-mir-28
gguccuugcccucaaggagcucacagucuauugaguuaccuuucugacuuucccacuagauugugagcuccuggagggcaggcacu
(((.(((((((((.((((((((((((((((.(((((((......)))))....)).)))))))))))))))).))))))))).))) (-50.20)
>hsa-mir-29a
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>hsa-mir-30a
GCGACUGUAAACAUCCUCGACUGGAAGCUGUGAAGCCACAGAUGGGCUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGCUGC
(((.((((((((((((..((((((((((((((....))).....))))))))))))))))))))))).))) (-37.20)
>hsa-mir-31
GGAGAGGAGGCAAGAUGCUGGCAUAGCUGUUGAACUGGGAACCUGCUAUGCCAACAUAUUGCCAUCUUUCC
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>hsa-mir-32
GGAGAUAUUGCACAUUACUAAGUUGCAUGUUGUCACGGCCUCAAUGCAAUUUAGUGUGUGUGAUAUUUUC
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>hsa-mir-33a
CUGUGGUGCAUUGUAGUUGCAUUGCAUGUUCUGGUGGUACCCAUGCAAUGUUUCCACAGUGCAUCACAG
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>hsa-mir-92a-1
CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCUGUGUUUCUGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG
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>hsa-mir-92a-2
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>hsa-mir-93
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>hsa-mir-95
AACACAGUGGGCACUCAAUAAAUGUCUGUUGAAUUGAAAUGCGUUACAUUCAACGGGUAUUUAUUGAGCACCCACUCUGUG
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>hsa-mir-96
UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUGUGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCCAAUAUGGGAAA
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>hsa-mir-98
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>hsa-mir-99a
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>hsa-mir-100
CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUAUUAGUCCGCACAAGCUUGUAUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGG
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>hsa-mir-101-1
UGCCCUGGCUCAGUUAUCACAGUGCUGAUGCUGUCUAUUCUAAAGGUACAGUACUGUGAUAACUGAAGGAUGGCA
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>hsa-mir-29b-1
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>hsa-mir-29b-2
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>hsa-mir-103a-2
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>hsa-mir-103a-1
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>hsa-mir-105-1
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>hsa-mir-105-2
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>hsa-mir-106a
CCUUGGCCAUGUAAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGCUUUUUGAGAUCUACUGCAAUGUAAGCACUUCUUACAUUACCAUGG
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>hsa-mir-107
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>hsa-mir-16-2
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>hsa-mir-192
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>hsa-mir-196a-1
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>hsa-mir-197
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>hsa-mir-198
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>hsa-mir-199a-1
GCCAACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAGGCUCUCAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC
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>hsa-mir-208a
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>hsa-mir-129-1
GGAUCUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCUGUUCCUCUCAACAGUAGUCAGGAAGCCCUUACCCCAAAAAGUAUCU
(((((((((((.(((..((((((.(((..(..((....))..).))).))))))..))).))))))).)))) (-29.50)
>hsa-mir-148a
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>hsa-mir-30c-2
AGAUACUGUAAACAUCCUACACUCUCAGCUGUGGAAAGUAAGAAAGCUGGGAGAAGGCUGUUUACUCUUUCU
(((....(((((((.(((...(((((((((..............))))))))).))).)))))))....))) (-25.40)
>hsa-mir-30d
GUUGUUGUAAACAUCCCCGACUGGAAGCUGUAAGACACAGCUAAGCUUUCAGUCAGAUGUUUGCUGCUAC
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>hsa-mir-139
GUGUAUUCUACAGUGCACGUGUCUCCAGUGUGGCUCGGAGGCUGGAGACGCGGCCCUGUUGGAGUAAC
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>hsa-mir-147a
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>hsa-mir-7-1
UUGGAUGUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG
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>hsa-mir-7-2
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>hsa-mir-7-3
AGAUUAGAGUGGCUGUGGUCUAGUGCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUCUGAUGUACUACGACAACAAGUCACAGCCGGCCUCAUAGCGCAGACUCCCUUCGAC
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>hsa-mir-10a
GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGUAAGGAAUUUUGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUCU
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>hsa-mir-10b
CCAGAGGUUGUAACGUUGUCUAUAUAUACCCUGUAGAACCGAAUUUGUGUGGUAUCCGUAUAGUCACAGAUUCGAUUCUAGGGGAAUAUAUGGUCGAUGCAAAAACUUCA
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>hsa-mir-34a
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>hsa-mir-181a-2
AGAAGGGCUAUCAGGCCAGCCUUCAGAGGACUCCAAGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUUGAAAAAACCACUGACCGUUGACUGUACCUUGGGGUCCUUA
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>hsa-mir-181b-1
CCUGUGCAGAGAUUAUUUUUUAAAAGGUCACAAUCAACAUUCAUUGCUGUCGGUGGGUUGAACUGUGUGGACAAGCUCACUGAACAAUGAAUGCAACUGUGGCCCCGCUU
.........................(((((((.....(((((((((...((((((((((....(((....))))))))))))).)))))))))....)))))))...... (-33.20)
>hsa-mir-181c
cggaaaauuugccaaggguuugggggaacauucaaccugucggugaguuugggcagcucaggcaaaccaucgaccguugaguggaCCCUGAGGCCUGGAAUUGCCAUCCU
.(((.......(((..(((((.((((..((((((((..(((((((.(((((...........)))))))))))).))))))))..)))).))))))))........))). (-45.20)
>hsa-mir-182
GAGCUGCUUGCCUCCCCCCGUUUUUGGCAAUGGUAGAACUCACACUGGUGAGGUAACAGGAUCCGGUGGUUCUAGACUUGCCAACUAUGGGGCGAGGACUCAGCCGGCAC
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>hsa-mir-183
CCGCAGAGUGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCAGUCAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCCACGA
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>hsa-mir-187
GGUCGGGCUCACCAUGACACAGUGUGAGACCUCGGGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGCUCUGACCCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGACGCAGGUCCGCA
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>hsa-mir-196a-2
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>hsa-mir-199a-2
AGGAAGCUUCUGGAGAUCCUGCUCCGUCGCCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGACAAUGCCGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGGCAAGGGAGAGCA
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>hsa-mir-199b
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>hsa-mir-203a
GUGUUGGGGACUCGCGCGCUGGGUCCAGUGGUUCUUAACAGUUCAACAGUUCUGUAGCGCAAUUGUGAAAUGUUUAGGACCACUAGACCCGGCGGGCGCGGCGACAGCGA
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>hsa-mir-204
GGCUACAGUCUUUCUUCAUGUGACUCGUGGACUUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCUGAGAAUAUAUGAAGGAGGCUGGGAAGGCAAAGGGACGUUCAAUUGUCAUCACUGGC
.....((((..........(((((...(((((.((((((((((.(((((.((((...............))))))))).)))))))))).)))))...))))).)))).. (-42.00)
>hsa-mir-205
AAAGAUCCUCAGACAAUCCAUGUGCUUCUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUGUCUCAUACCCAACCAGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAGGCAUGGAGCUGACA
........((((.(..(((((((....((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..)))))))))))))))))).. (-46.20)
>hsa-mir-210
ACCCGGCAGUGCCUCCAGGCGCAGGGCAGCCCCUGCCCACCGCACACUGCGCUGCCCCAGACCCACUGUGCGUGUGACAGCGGCUGAUCUGUGCCUGGGCAGCGCGACCC
....((..((((.(((((((((((..(((((.(((..(((((((((.((.((((...))).).)).)))))).))).))).)))))..)))))))))))..))))..)). (-59.50)
>hsa-mir-211
UCACCUGGCCAUGUGACUUGUGGGCUUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCUAGGGCUCUGAGCAGGGCAGGGACAGCAAAGGGGUGCUCAGUUGUCACUUCCCACAGCACGGAG
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>hsa-mir-212
CGGGGCACCCCGCCCGGACAGCGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCUCAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCCCGCC
((((((...((....)).(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).)))))))))))).. (-49.90)
>hsa-mir-181a-1
UGAGUUUUGAGGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUUAAAAUCAAAACCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCUAACCAUCAUCUACUCCA
.((((..((((((((((..((.(.(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).))).).))..))).)))).)))...)))).. (-35.90)
>hsa-mir-214
GGCCUGGCUGGACAGAGUUGUCAUGUGUCUGCCUGUCUACACUUGCUGUGCAGAACAUCCGCUCACCUGUACAGCAGGCACAGACAGGCAGUCACAUGACAACCCAGCCU
.....((((((.....(((((((((((.((((((((((...((((((((((((.............))))))))))))...)))))))))).))))))))))))))))). (-67.50)
>hsa-mir-215
AUCAUUCAGAAAUGGUAUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAAUAUAGCUGAGUUUGUCUGUCAUUUCUUUAGGCCAAUAUUCUGUAUGACUGUGCUACUUCAA
...........(((((((((((((...((.((((.(((.((((((((((...........)))))))))).)))..)))).))...)))))))).))))).......... (-33.00)
>hsa-mir-216a
GAUGGCUGUGAGUUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAACUGUGAGAUGUUCAUACAAUCCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAAACAGAGCAAUUUCCUAGCCCUCACGA
((.(((((.((((((((.(((((((((..(((.((((((((.(((....)))....)))))))).))).))))))))).)))))..........))).))))).)).... (-40.30)
>hsa-mir-217
AGUAUAAUUAUUACAUAGUUUUUGAUGUCGCAGAUACUGCAUCAGGAACUGAUUGGAUAAGAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAAG
.(((.......)))...((((..(((((.(.((.((.(((((.((((((((((.((((........))).).)))))))))).))))).)).)).).))))).))))... (-31.60)
>hsa-mir-218-1
GUGAUAAUGUAGCGAGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCGAGGUAUGAGUAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCAUGGAACGUCACGCAGCUUUCUACA
(((..((.((.(((.(((.((((((.(((((((((..((((((((..((((.........)))).))))))))..))))))))).)))))).))).))).))))..))). (-40.00)
>hsa-mir-218-2
GACCAGUCGCUGCGGGGCUUUCCUUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUGGAACGAUGGAAACGGAACAUGGUUCUGUCAAGCACCGCGGAAAGCACCGUGCUCUCCUGCA
...(((..((.((((.(((((((...(((((((((..((((((((..((............))..))))))))..)))))))))...))))))).))))))....))).. (-44.60)
>hsa-mir-219a-1
CCGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAUGGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGCGGG
((((.(.((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).)))).........).)))). (-54.20)
>hsa-mir-221
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>hsa-mir-30c-1
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((((((.((((..(((((((..(((((((((.((.(((....)))...)).)))))))))..)))))))..)))).)))))) (-35.80)
>hsa-mir-30e
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>hsa-mir-26a-2
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>hsa-mir-361
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>hsa-mir-363
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>hsa-mir-365a
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>hsa-mir-365b
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>hsa-mir-302b
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>hsa-mir-302c
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>hsa-mir-367
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>hsa-mir-526b
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>hsa-mir-519b
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>hsa-mir-525
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>hsa-mir-523
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>hsa-mir-520b
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>hsa-mir-583
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>hsa-mir-584
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>hsa-mir-585
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>hsa-mir-548a-1
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>hsa-mir-660
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>hsa-mir-421
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>hsa-mir-942
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>hsa-mir-943
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>hsa-mir-944
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>hsa-mir-297
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>hsa-mir-1178
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>hsa-mir-1179
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>hsa-mir-1180
GCUGCUGGACCCACCCGGCCGGGAAUAGUGCUCCUGGUUGUUUCCGGCUCGCGUGGGUGUGUCGGCGGC
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>hsa-mir-1181
UCCACUGCUGCCGCCGUCGCCGCCACCCGAGCCGGAGCGGGCUGGGCCGCCAAGGCAAGAUGGUGGACUACAGCGUGUGGG
.((((((((((((((((((((((..(((.((((......)))))))..))...)))..))))))))....))))).)))). (-42.00)
>hsa-mir-1182
GGGACUUGUCACUGCCUGUCUCCUCCCUCUCCAGCAGCGACUGGAUUCUGGAGUCCAUCUAGAGGGUCUUGGGAGGGAUGUGACUGUUGGGAAGCCC
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>hsa-mir-1183
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>hsa-mir-1184-1
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>hsa-mir-548h-3
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>hsa-mir-3130-1
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>hsa-mir-3131
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>hsa-mir-3133
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>hsa-mir-378b
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>hsa-mir-3134
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>hsa-mir-3202-2
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>hsa-mir-1273d
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>hsa-mir-4295
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>hsa-mir-4297
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>hsa-mir-378c
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>hsa-mir-4293
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>hsa-mir-4301
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>hsa-mir-3615
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>hsa-mir-3680-1
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>hsa-mir-3910-1
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>hsa-mir-3915
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>hsa-mir-3910-2
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>hsa-mir-3924
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>hsa-mir-3926-1
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>hsa-mir-676
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>hsa-mir-3926-2
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>hsa-mir-3928
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>hsa-mir-3929
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>hsa-mir-3934
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>hsa-mir-3935
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>hsa-mir-3936
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>hsa-mir-3938
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>hsa-mir-548y
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>hsa-mir-4648
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>hsa-mir-4649
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>hsa-mir-4650-1
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>hsa-mir-4738
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>hsa-mir-4741
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>hsa-mir-4742
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>hsa-mir-4743
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>hsa-mir-4744
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>hsa-mir-5095
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>hsa-mir-1273f
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>hsa-mir-6770-1
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>hsa-mir-8069-1
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>hsa-mir-8070
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>hsa-mir-8071-1
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>hsa-mir-8072
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>hsa-mir-8073
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>hsa-mir-8074
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>hsa-mir-8075
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>hsa-mir-8076
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>hsa-mir-8077
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>hsa-mir-8078
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