org.eclipse.jgit.api.errors.CheckoutConflictException happens in Mac

[YoshikiHigo]

対象：https://github.com/zxing/zxing
コマンド：git fg --src zxing.git --des zxing.fg

> git fg --src zxing.git --des zxing.fg
org.eclipse.jgit.api.errors.CheckoutConflictException: Checkout conflict with file: Cannot delete file: /Users/higo/Data/tmp/zxing.fg/.github
	at org.eclipse.jgit.api.ResetCommand.checkoutIndex(ResetCommand.java:449)
	at org.eclipse.jgit.api.ResetCommand.call(ResetCommand.java:215)
	at finergit.GitRepo.resetHard(GitRepo.java:488)
	at finergit.TreeRewriteFinerRepoBuilder.exec(TreeRewriteFinerRepoBuilder.java:45)
	at finergit.FinerGitMain.exec(FinerGitMain.java:65)
	at finergit.FinerGitMain.main(FinerGitMain.java:40)
	at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
	at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:62)
	at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
	at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:498)
	at finergit.JarEntryPoint.main(JarEntryPoint.java:21)
Caused by: org.eclipse.jgit.errors.CheckoutConflictException: Checkout conflict with file: Cannot delete file: /Users/higo/Data/tmp/zxing.fg/.github
	at org.eclipse.jgit.dircache.DirCacheCheckout.cleanUpConflicts(DirCacheCheckout.java:1282)
	at org.eclipse.jgit.dircache.DirCacheCheckout.doCheckout(DirCacheCheckout.java:518)
	at org.eclipse.jgit.dircache.DirCacheCheckout.checkout(DirCacheCheckout.java:484)
	at org.eclipse.jgit.api.ResetCommand.checkoutIndex(ResetCommand.java:447)
	... 10 more

[sh5i]

再現しました．コミットされていない（子を持つ）ディレクトリをクリーンアップできないという jgit のバグだと思います．以下のコメントを見る限り，認識はされているようです．
https://github.com/eclipse/jgit/blob/master/org.eclipse.jgit/src/org/eclipse/jgit/dircache/DirCacheCheckout.java#L1271

[YoshikiHigo]

あー，そうなんですね，どうしようかな..

[sh5i]

#114 同様，git コマンドを使えば正しく動きます．
Java 層で解決する場合，正攻法（本家を直す）以外の workaround としては，この例外が上がってきたときに，ディレクトリを消して再挑戦することはできると思います．

[sh5i]

あるいは，ファイルをすべて消した状態から始めるという方法もあるかもしれません．

[YoshikiHigo]

とりあえずの対処として，そのエラーが起こった場合には手動で git reset --hard と git clean をすることにします．例の100のプロジェクトで数個程度だったので．