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DASF Seismic Lite

Este repositório contém uma implementação de referência para classificação de fácies sísmicas com o K-means usando o DASF. O pipeline de classificação é mostrado na figura abaixo pipeline

Para permitir a extração de atributos sísmicos, uma versão leve do dasf-seismic, intitulada dasf-seismic-lite, é disponibilizada no diretório dasf-seismic-lite.

Instalação

Para instalar o dasf-seismic-lite:

  1. Clone o repositório do dasf-core e crie uma imagem docker de cpu. Para isso, você pode executar os seguintes comandos (em uma pasta fora deste repositório), que irá gerar uma imagem docker chamada dasf:cpu:
git clone https://github.com/discovery-unicamp/dasf-core.git
cd dasf-core/build
CONTAINER_CMD=docker ./build_container.sh cpu
  1. Clone este repositório e crie uma imagem docker que irá instalar o dasf-seismic-lite. Neste repositório, foi disponibilizado um script para facilitar a criação da imagem docker. Para isso, entre dentro do diretório raiz deste repositório e execute o script build_docker.sh, que irá gerar uma imagem docker chamada dasf-seismic:cpu, conforme abaixo:
./build_docker.sh

Execução único nó

  1. Dentro da pasta data deste repositótio, você deve colocar seus arquivos sísmicos npy de treino disponibilizados. No caso, o arquivo F3_train.npy.

  2. Execute o comando abaixo para executar o script reference.py dentro do container. O parâmetro --data informa o caminho do dado numpy:

docker run -it -v $(pwd):$(pwd) -e HOME=$(pwd) -w $(pwd) -u $(id -u):$(id -g) --network=host dasf-seismic:cpu python3 reference.py --data data/F3_train.npy

Execução multi-nós

  1. Instancie um dask scheduler (o endereço do scheduler será mostrado no terminal, será algo semelhante a tcp://192.168.1.164:8786):
docker run -it -v $(pwd):$(pwd) -e HOME=$(pwd) -w $(pwd) -u $(id -u):$(id -g) --network=host dasf-seismic:cpu dask scheduler
  1. Instancie um dask worker e conecte-o ao shceduler criado no passo anterior (substitua <scheduler_address> pelo endereço do scheduler, será algo semelhante a tcp://192.168.1.164:8786)
docker run -it -v $(pwd):$(pwd) -e HOME=$(pwd) -w $(pwd) -u $(id -u):$(id -g) --network=host dasf-seismic:cpu dask worker <scheduler_address>
  1. Execute a implementação de referencia (reference.py) passando o endereço do scheduler para o parâmetro --address (substitua <scheduler_address> pelo endereço do scheduler, será algo semelhante a tcp://192.168.1.164:8786)
docker run -it -v $(pwd):$(pwd) -e HOME=$(pwd) -w $(pwd) -u $(id -u):$(id -g) --network=host dasf-seismic:cpu python3 reference.py --data data/F3_train.npy --address <scheduler_address>

NOTA: Lembre-se de executar os comandos acima na pasta raiz deste repositório.

Informações úteis

  • Voce pode acessar o dashborard do dask no nó que executa o scheduler, através do endereço http://localhost:8787/status
  • Você pode salvar o resultado da predição da inline 0, feito pelo K-Means adicionando o parâmetro --save-inline-fig output.png ao script que reference.py.