Equipo organizador: Azul Silva, Cecilia Herbert, Marcos Coletti y Verónica de la Fuente
Docentes: Marcos Coletti y Juan Ignacio Sanguinetti Scheck
Docentes asistentes: Azul Silva, Cecilia Herbert y Verónica de la Fuente
Colaboradores: Alejandro Cámera y Matías Andina
La lista de reproducción de las clases teóricas y de las charlas de oradorxs internacionales invitadxs se encuentra en nuestro canal de YouTube.
En la carpeta Materiales de este respositorio encontrarás las presentaciones teóricas, las guías de ejericios del curso y algunos materiales adicionales para la parte práctica (archivos de código, resoluciones de ejercicios y material complementario).
También encontrarás un listado con el contenido del kit. No olvides leer las recomendaciones de seguridad antes de comenzar a trabajar.
En el canal "curso-adquisición" del Discord de nuestra comunidad podrás discutir dudas, siguiendo nuestro Código de Conducta.
Este taller propone abordar la adquisición de bioseñales y el estudio del comportamiento animal para que las herramientas y metodologías que utilizamos dejen de ser cajas negras. Vas a aprender a armar un sistema de adquisición básico desde cero con componentes electrónicos y una placa Arduino. Usando este equipo hecho con nuestras manos, registraremos y analizaremos la actividad eléctrica de nuestros músculos como ejemplo didáctico. Finalmente, utilizando Bonsai, un software muy flexible diseñado para el análisis de video y control de experimentos, veremos estrategias para estudiar comportamiento, controlar estímulos y eventualmente sincronizarlos con bioseñales. Abordaremos estas actividades desde una perspectiva de ciencia abierta y tecnologías libres, que nos ayudarán a hacer nuestro trabajo más reproducible, adaptable y colaborativo.
25 estudiantes de 8 países de latinoamérica fueron seleccionadxs para recibir el kit de materiales y asistir al curso en la modalidad sincrónica intensiva de una semana que se desarrolló en noviembre de 2021.
Teórica: “Introducción a la electrónica”. Ley de Ohm. Componentes electrónicos básicos. Arduino: hardware y software. Señales digitales y analógicas.
Práctica: Trabajando con Arduino. Puertos digitales: control de LEDs con y sin pulsadores. Movimiento de servomotor. Adquisición de datos a través de puertos analógicos.
Teórica: “Bioseñales”. Tipos de señales biológicas. Registros experimentales. Fuentes de ruido. Electrodo de referencia. Amplificador operacional. Frecuencia de muestreo.
Práctica: Trabajando con Arduino. Amplificadores operacionales. Adquisición de señales.
Teórica: Amplificadores operacionales, diferenciales y de instrumentacion. CMRR. Ondas. Filtros. Transformada de Fourier.
Práctica: “Medición del electrocardiograma”. Montaje del set-up usando la placa de Arduino. Registro y filtrado de la señal. Amplificación y digitalización. Interacción entre señal y la placa de Arduino.
Teórica: Introducción al software Bonsai. Ventajas y aplicaciones.Tipos de operadores. Construcción de flujos de trabajo.
Práctica: Controlando Arduino desde Bonsai. Adquisición de video. Adquisición de audio. Emisión de sonidos. Seguimiento de objetos. Medición de movimiento.
Teórica: Primeros pasos en (neuro)ciencia abierta. Conversaciones finales sobre el origen y futuro del taller y la selección y distribución de lxs participantes. Género y áreas CTIM (Ciencia, Tecnología, Ingeniería y Matemática como cierre de la discusión del evento social con estudiantes sincrónicxs).
Práctica: Continuación de ejercicios con Bonsai. Sistemas closed-loop. Medición de latencias. Control de señales en base al movimiento de un objeto: encendido de LED o movimiento de un servo.
Este taller fue realizado gracias al apoyo de:
- la International Brain Research Organization (IBRO-LARC)
- la Sociedad Argentina de Investigación en Neurociencias
- el Fondo Metropolitano de la Ciudad de Buenos Aires.