-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
Copy pathrmsf.xvg
2860 lines (2860 loc) · 42.1 KB
/
rmsf.xvg
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
# This file was created Thu Jan 7 12:59:20 2010
# by the following command:
# g_rmsf -f ../Trajs/mdTot_nojump.xtc -s ../steep2_out.gro -n index_anal.ndx -b 5000.0 -dt 10.0
#
# g_rmsf is part of G R O M A C S:
#
# Go Rough, Oppose Many Angry Chinese Serial killers
#
@ title "RMS fluctuation"
@ xaxis label "Atom"
@ yaxis label "(nm)"
@TYPE xy
1 0.3253
2 0.2577
3 0.2330
4 0.1791
5 0.1793
6 0.1667
7 0.1599
8 0.1819
9 0.1895
10 0.1565
11 0.1455
12 0.1299
13 0.1363
14 0.1581
15 0.1946
16 0.2129
17 0.2258
18 0.2152
19 0.2239
20 0.2265
21 0.2445
22 0.2757
23 0.2711
24 0.2721
25 0.2563
26 0.2726
27 0.2640
28 0.2887
29 0.3111
30 0.3064
31 0.2823
32 0.2961
33 0.2916
34 0.2610
35 0.2527
36 0.2632
37 0.2525
38 0.2339
39 0.2420
40 0.2457
41 0.2320
42 0.2290
43 0.2499
44 0.2470
45 0.2391
46 0.2145
47 0.1932
48 0.1834
49 0.1869
50 0.1831
51 0.1851
52 0.2084
53 0.2654
54 0.2854
55 0.3240
56 0.3211
57 0.3888
58 0.3711
59 0.2488
60 0.2313
61 0.2177
62 0.2258
63 0.2353
64 0.2161
65 0.2092
66 0.2326
67 0.2321
68 0.2099
69 0.2277
70 0.2552
71 0.2757
72 0.2855
73 0.2285
74 0.2298
75 0.2079
76 0.1992
77 0.2084
78 0.1827
79 0.1531
80 0.1504
81 0.1453
82 0.1519
83 0.1638
84 0.1581
85 0.1649
86 0.1793
87 0.1743
88 0.1915
89 0.2230
90 0.2013
91 0.2044
92 0.1907
93 0.1721
94 0.1697
95 0.1619
96 0.1400
97 0.1187
98 0.1052
99 0.1173
100 0.1301
101 0.1205
102 0.1194
103 0.1385
104 0.1476
105 0.1404
106 0.1536
107 0.1749
108 0.1701
109 0.1730
110 0.1971
111 0.2035
112 0.1953
113 0.1862
114 0.1650
115 0.1557
116 0.1428
117 0.1331
118 0.1258
119 0.1240
120 0.1255
121 0.1456
122 0.1548
123 0.1788
124 0.2123
125 0.2117
126 0.1936
127 0.1966
128 0.1744
129 0.1543
130 0.1671
131 0.1564
132 0.1423
133 0.1419
134 0.1405
135 0.1243
136 0.1264
137 0.1231
138 0.1114
139 0.1146
140 0.1156
141 0.1142
142 0.1113
143 0.1365
144 0.1450
145 0.1402
146 0.1245
147 0.1074
148 0.1076
149 0.1102
150 0.1218
151 0.1453
152 0.1601
153 0.1811
154 0.2295
155 0.2282
156 0.2684
157 0.2557
158 0.2358
159 0.2070
160 0.1925
161 0.2000
162 0.1822
163 0.1532
164 0.1543
165 0.1616
166 0.1376
167 0.1222
168 0.1480
169 0.1550
170 0.1441
171 0.1489
172 0.1503
173 0.1536
174 0.1512
175 0.1492
176 0.1488
177 0.1579
178 0.1882
179 0.2074
180 0.2583
181 0.2990
182 0.3135
183 0.3402
184 0.3292
185 0.3815
186 0.3834
187 0.3367
188 0.3403
189 0.4243
190 0.3898
191 0.2399
192 0.3038
193 0.3420
194 0.2630
195 0.2334
196 0.3072
197 0.2999
198 0.2216
199 0.2859
200 0.3210
201 0.2309
202 0.1965
203 0.1816
204 0.1780
205 0.1969
206 0.1929
207 0.2330
208 0.2622
209 0.3127
210 0.3130
211 0.3533
212 0.3485
213 0.3220
214 0.3660
215 0.4053
216 0.4149
217 0.4163
218 0.3852
219 0.3689
220 0.4078
221 0.5334
222 0.5136
223 0.4607
224 0.4108
225 0.3832
226 0.3664
227 0.3513
228 0.3673
229 0.3449
230 0.4090
231 0.4896
232 0.4333
233 0.4452
234 0.4647
235 0.4484
236 0.4778
237 0.4645
238 0.4349
239 0.4465
240 0.4642
241 0.4654
242 0.4756
243 0.5063
244 0.5193
245 0.5363
246 0.4975
247 0.4633
248 0.5046
249 0.5017
250 0.4449
251 0.4600
252 0.5004
253 0.4623
254 0.4310
255 0.4950
256 0.4949
257 0.4229
258 0.4385
259 0.4877
260 0.4499
261 0.4048
262 0.4454
263 0.4669
264 0.4209
265 0.4101
266 0.3880
267 0.3790
268 0.3650
269 0.3534
270 0.3418
271 0.3492
272 0.3409
273 0.3180
274 0.3221
275 0.3310
276 0.3083
277 0.2848
278 0.3070
279 0.3168
280 0.3244
281 0.2688
282 0.2412
283 0.2082
284 0.2107
285 0.2334
286 0.2311
287 0.2493
288 0.2582
289 0.2749
290 0.2889
291 0.3174
292 0.3337
293 0.3582
294 0.3310
295 0.3135
296 0.3368
297 0.3354
298 0.3240
299 0.3283
300 0.3683
301 0.3519
302 0.3365
303 0.3363
304 0.3396
305 0.3240
306 0.3553
307 0.3804
308 0.3710
309 0.4152
310 0.4343
311 0.4914
312 0.4570
313 0.3965
314 0.4467
315 0.4865
316 0.4201
317 0.4012
318 0.4674
319 0.4717
320 0.4080
321 0.3844
322 0.3981
323 0.3949
324 0.3656
325 0.4539
326 0.4911
327 0.2644
328 0.1529
329 0.1374
330 0.1521
331 0.1508
332 0.1471
333 0.1522
334 0.1503
335 0.1711
336 0.1677
337 0.1600
338 0.1572
339 0.1355
340 0.1358
341 0.1338
342 0.1433
343 0.1645
344 0.1768
345 0.1568
346 0.1564
347 0.1844
348 0.1840
349 0.1731
350 0.1917
351 0.2012
352 0.1734
353 0.1628
354 0.1370
355 0.1528
356 0.1793
357 0.1859
358 0.2083
359 0.1899
360 0.1666
361 0.1871
362 0.2068
363 0.1766
364 0.1754
365 0.1951
366 0.2291
367 0.2330
368 0.1904
369 0.1446
370 0.1458
371 0.1515
372 0.1571
373 0.1671
374 0.1919
375 0.1685
376 0.1528
377 0.1381
378 0.1376
379 0.1371
380 0.1240
381 0.1196
382 0.1262
383 0.1300
384 0.1299
385 0.1376
386 0.1404
387 0.1468
388 0.1568
389 0.1715
390 0.1759
391 0.1649
392 0.1660
393 0.1446
394 0.1409
395 0.1523
396 0.1645
397 0.1915
398 0.1912
399 0.1824
400 0.1910
401 0.1816
402 0.1971
403 0.1827
404 0.1573
405 0.1606
406 0.1693
407 0.1549
408 0.1476
409 0.1680
410 0.1755
411 0.1619
412 0.1718
413 0.1631
414 0.1891
415 0.1809
416 0.1773
417 0.1561
418 0.1519
419 0.1567
420 0.1554
421 0.1503
422 0.1592
423 0.1779
424 0.1840
425 0.1762
426 0.1683
427 0.1899
428 0.2142
429 0.2219
430 0.2029
431 0.2162
432 0.2057
433 0.2193
434 0.2530
435 0.2558
436 0.2732
437 0.2997
438 0.3041
439 0.3048
440 0.2939
441 0.2741
442 0.2642
443 0.2657
444 0.2571
445 0.2366
446 0.2391
447 0.2414
448 0.2206
449 0.2085
450 0.2326
451 0.2332
452 0.2531
453 0.2880
454 0.2698
455 0.2825
456 0.2743
457 0.2482
458 0.2429
459 0.2472
460 0.2374
461 0.2192
462 0.2176
463 0.2217
464 0.2120
465 0.2017
466 0.2058
467 0.1979
468 0.1873
469 0.1860
470 0.1985
471 0.1831
472 0.1642
473 0.1840
474 0.1877
475 0.1744
476 0.1752
477 0.1938
478 0.1909
479 0.1838
480 0.1992
481 0.2333
482 0.2568
483 0.2351
484 0.2514
485 0.3051
486 0.2954
487 0.2608
488 0.2978
489 0.2967
490 0.3316
491 0.3668
492 0.4054
493 0.4019
494 0.3669
495 0.3100
496 0.2821
497 0.2333
498 0.2316
499 0.2416
500 0.2163
501 0.2092
502 0.2252
503 0.2325
504 0.2159
505 0.2031
506 0.2014
507 0.2136
508 0.2556
509 0.2669
510 0.3043
511 0.3025
512 0.3052
513 0.2791
514 0.2768
515 0.2463
516 0.2350
517 0.2146
518 0.2204
519 0.2288
520 0.2155
521 0.2044
522 0.2194
523 0.2235
524 0.2097
525 0.2105
526 0.2232
527 0.2190
528 0.2099
529 0.2197
530 0.2316
531 0.2203
532 0.2174
533 0.2328
534 0.2422
535 0.2223
536 0.2271
537 0.2420
538 0.2453
539 0.2291
540 0.2643
541 0.2685
542 0.2463
543 0.2376
544 0.2052
545 0.1995
546 0.1887
547 0.1736
548 0.1836
549 0.1629
550 0.1717
551 0.1840
552 0.1786
553 0.1763
554 0.1966
555 0.1928
556 0.1750
557 0.1899
558 0.2028
559 0.2280
560 0.2286
561 0.2231
562 0.2244
563 0.2226
564 0.2156
565 0.2384
566 0.2516
567 0.2369
568 0.2346
569 0.2569
570 0.2583
571 0.2478
572 0.2583
573 0.2476
574 0.2499
575 0.2579
576 0.2433
577 0.2215
578 0.2286
579 0.2349
580 0.2199
581 0.2009
582 0.1778
583 0.1960
584 0.1978
585 0.1681
586 0.1628
587 0.1829
588 0.1742
589 0.1585
590 0.1706
591 0.1760
592 0.1682
593 0.1687
594 0.1832
595 0.1829
596 0.1807
597 0.1826
598 0.1814
599 0.1802
600 0.1978
601 0.1973
602 0.1823
603 0.1721
604 0.1588
605 0.1584
606 0.1616
607 0.1483
608 0.1390
609 0.1501
610 0.1469
611 0.1337
612 0.1393
613 0.1506
614 0.1419
615 0.1299
616 0.1403
617 0.1448
618 0.1237
619 0.1224
620 0.1405
621 0.1334
622 0.1189
623 0.1307
624 0.1362
625 0.1190
626 0.1204
627 0.1313
628 0.1297
629 0.1212
630 0.1178
631 0.1277
632 0.1357
633 0.1248
634 0.1284
635 0.1413
636 0.1395
637 0.1330
638 0.1396
639 0.1522
640 0.1509
641 0.1515
642 0.1611
643 0.1844
644 0.2061
645 0.2150
646 0.1996
647 0.1693
648 0.1485
649 0.1407
650 0.1459
651 0.1435
652 0.1364
653 0.1357
654 0.1304
655 0.1234
656 0.1191
657 0.1159
658 0.1123
659 0.1099
660 0.1064
661 0.1175
662 0.1281
663 0.1184
664 0.1066
665 0.1066
666 0.1101
667 0.1136
668 0.1100
669 0.1391
670 0.1426
671 0.1344
672 0.1322
673 0.1311
674 0.1425
675 0.1417
676 0.1427
677 0.1463
678 0.1320
679 0.1270
680 0.1369
681 0.1413
682 0.1277
683 0.1235
684 0.1308
685 0.1278
686 0.1261
687 0.1189
688 0.1213
689 0.1296
690 0.1260
691 0.1172
692 0.1305
693 0.1366
694 0.1145
695 0.1185
696 0.1252
697 0.1189
698 0.1267
699 0.1288
700 0.1194
701 0.1212
702 0.1322
703 0.1300
704 0.1306
705 0.1412
706 0.1402
707 0.1422
708 0.1490
709 0.1734
710 0.3099
711 0.4350
712 0.6545
713 0.2823
714 0.1864
715 0.1478
716 0.1383
717 0.1255
718 0.1165
719 0.1083
720 0.1173
721 0.1130
722 0.1045
723 0.1158
724 0.1131
725 0.1288
726 0.1212
727 0.1342
728 0.1373
729 0.1476
730 0.1429
731 0.1495
732 0.1507
733 0.1489
734 0.1564
735 0.1924
736 0.1881
737 0.2078
738 0.2715
739 0.2612
740 0.2389
741 0.2530
742 0.2523
743 0.2394
744 0.2448
745 0.2486
746 0.2134
747 0.2057
748 0.2274
749 0.2139
750 0.1827
751 0.1966
752 0.2100
753 0.1861
754 0.1767
755 0.2067
756 0.2007
757 0.1761
758 0.1524
759 0.1434
760 0.1306
761 0.1349
762 0.1296
763 0.1266
764 0.1384
765 0.1353
766 0.1468
767 0.1662
768 0.1900
769 0.2551
770 0.2617
771 0.1825
772 0.1663
773 0.1465
774 0.1572
775 0.1723
776 0.1593
777 0.1560
778 0.1757
779 0.1852
780 0.1732
781 0.1969
782 0.2386
783 0.2598
784 0.2673
785 0.1976
786 0.1909
787 0.1746
788 0.1641
789 0.1642
790 0.1463
791 0.1231
792 0.1216
793 0.1148
794 0.1178
795 0.1048
796 0.0998
797 0.1111
798 0.1246
799 0.1306
800 0.1683
801 0.1858
802 0.1592
803 0.1415
804 0.1370
805 0.1173
806 0.1273
807 0.1337
808 0.1025
809 0.1136
810 0.1010
811 0.1000
812 0.1007
813 0.0935
814 0.0974
815 0.1085
816 0.1177
817 0.1083
818 0.1117
819 0.1224
820 0.1230
821 0.1239
822 0.1326
823 0.1420
824 0.1393
825 0.1467
826 0.1370
827 0.1339
828 0.1175
829 0.1148
830 0.1108
831 0.0997
832 0.0979
833 0.0936
834 0.0953
835 0.1066
836 0.1192
837 0.1281
838 0.1297
839 0.1578
840 0.1397
841 0.1173
842 0.1201
843 0.1162
844 0.1054
845 0.0963
846 0.0960
847 0.0927
848 0.0909
849 0.0921
850 0.1003
851 0.1045
852 0.0947
853 0.0940
854 0.0951
855 0.1192
856 0.2089
857 0.1525
858 0.1166
859 0.0996
860 0.0993
861 0.0913
862 0.0965
863 0.0925
864 0.0981
865 0.1059
866 0.1254
867 0.1232
868 0.1627
869 0.1442
870 0.1322
871 0.1199
872 0.1091
873 0.1188
874 0.1169
875 0.1049
876 0.1065
877 0.1205
878 0.1168
879 0.0977
880 0.1074
881 0.1257
882 0.1140
883 0.1053
884 0.0980
885 0.0949
886 0.0988
887 0.0946
888 0.0957
889 0.0982
890 0.1051
891 0.1150
892 0.1332
893 0.1581
894 0.1691
895 0.2011
896 0.2195
897 0.2428
898 0.2282
899 0.2059
900 0.2268
901 0.1992
902 0.1744
903 0.1779
904 0.1840
905 0.1563
906 0.1377
907 0.1452
908 0.1531
909 0.1393
910 0.1330
911 0.1520
912 0.1396
913 0.1354
914 0.1255
915 0.1092
916 0.1091
917 0.1148
918 0.1166
919 0.1310
920 0.1520
921 0.2049
922 0.2082
923 0.2465
924 0.3081
925 0.3130
926 0.3011
927 0.3066
928 0.2909
929 0.2641
930 0.2616
931 0.2844
932 0.3221
933 0.3027
934 0.3819
935 0.3516
936 0.3185
937 0.3172
938 0.3518
939 0.3423
940 0.3211
941 0.3063
942 0.3170
943 0.3494
944 0.3515
945 0.3661
946 0.4535
947 0.3353
948 0.3675
949 0.3674
950 0.3097
951 0.3227
952 0.3725
953 0.3450
954 0.3079
955 0.3585
956 0.3742
957 0.3621
958 0.3521
959 0.3210
960 0.3255
961 0.3213
962 0.2975
963 0.2973
964 0.3081
965 0.2905
966 0.2738
967 0.2897
968 0.2932
969 0.2662
970 0.2691
971 0.2877
972 0.2740
973 0.2530
974 0.2720
975 0.2853
976 0.2630
977 0.2628
978 0.2439
979 0.2455
980 0.2374
981 0.2150
982 0.2033
983 0.2082
984 0.2017
985 0.1754
986 0.1758
987 0.1821
988 0.1651