Clean up test data folders

[phackstock]

Closes #400.
This PR implements the much needed clean-up of the test data folder.
From previously:

├── data
│   ├── add-missing-variables
│   ├── check_aggregate
│   ├── custom_dimension_nc
│   ├── definitions1
│   ├── definitions2
│   ├── definitions3
│   ├── double_stacked_external_repo
│   ├── duplicate-code-list
│   ├── duplicate_code_raises
│   ├── duplicate_tag_raises
│   ├── empty_definitions_dir
│   ├── end_whitespace
│   ├── excel_io
│   ├── extras_nc
│   ├── failing_variable_codelist
│   ├── general-config
│   ├── general-config-only
│   ├── general-config-only-country
│   ├── general-config-only-nuts
│   ├── general_filtering
│   ├── hidden_character
│   ├── invalid_yaml
│   ├── meta
│   ├── model_registration
│   ├── multiple_unit_codelist
│   ├── nomenclature_configs
│   ├── non-default_dimensions
│   ├── non-default_dimensions_one_empty
│   ├── non-default_folders
│   ├── region_aggregation
│   ├── region_codelist
│   ├── region_processing
│   ├── regionprocessor_duplicate
│   ├── regionprocessor_exclude_region_overlap
│   ├── regionprocessor_not_defined
│   ├── regionprocessor_unexpected_region
│   ├── regionprocessor_working
│   ├── region_to_filter_codelist
│   ├── required_data
│   ├── simple_codelist
│   ├── stray_tag
│   ├── structure_validation
│   ├── structure_validation_fails
│   ├── structure_validation_no_mappings
│   ├── tagged_codelist
│   ├── validation
│   ├── validation_nc
│   ├── variable_codelist_complex_attr
│   └── workflow

we now have:

├── data
│   ├── check_aggregate
│   ├── cli
│   ├── codelist
│   ├── config
│   ├── data_structure_definition
│   ├── IO
│   ├── meta_validator
│   ├── model_registration
│   ├── region_processing
│   ├── required_data
│   ├── validation
│   └── workflow

[danielhuppmann]

Thanks a lot!

One minor quibble: maybe rename the folder “IO” to lowercase for consistency.

But good to be merged either way.

[dc-almeida]

Thanks, quite convenient!