Para reproducir lo que se encuentra en el repo oficial:
rm --force --recursive dimorfismo
git clone https://github.com/IslasGECI/dimorfismo
cd dimorfismo
docker build --no-cache --tag islasgeci/dimorfismo:latest .
docker run --rm --volume ${PWD}:/workdir islasgeci/dimorfismo:latest make
Para examinar un fork:
BRANCH='nombre/rama'
REMOTE='andrea-sanchez'
REPO='dimorfismo'
rm --force --recursive ${REPO}
git clone https://github.com/${REMOTE}/${REPO}
cd ${REPO}
git checkout ${BRANCH}
docker build --no-cache --tag ${REMOTE}/${REPO}:latest .
docker run --rm --volume ${PWD}:/workdir ${REMOTE}/${REPO}:latest make
- Cubrir el código con pruebas.
- Refactorizar programas principales en R.
- Publicar nota en bioRxiv o JOSS.
- Desarrollar archivo Makefile para poder reenderizar PDF a partir de resultados en
src/
. - Mostrar en el PDF los resultados obtenidos en los archivos CSV y JSON.
- Redactar un reporte semanal con las actividades realizadas declarando su intensión u objetivo.
- Reporte final con base en reportes semanales.