Projet_Alignement_De_Sequences_Genomes

Ce projet porte sur un problème de génomique : l’alignement de séquences.

Différents algorithmes et deux types de paradigmes de programmation sont utilisés : la programmation dynamique et la programmation impérative, pour résoudre le problème de l'alignement des séquences de deux génomes.

Déploiement

Vous devez avoir python 3.x ou supérieur pour le faire fonctionner.

    python3 --version

    # Si la commande ci-dessus fonctionne pas faire :
    #sudo apt-get update
    #sudo apt-get install python3.6

    # Installation des packages nécessaires au fonctionnement
    pip install -r requirements.txt

Installation

Cloner le repo du projet.

  git clone https://github.com/KyroFrCode/Projet_Alignement_De_Sequences_Genomes.git
  cd Projet_Alignement_De_Sequences_Genomes/code/

Exécution du fichier test

python3 test.py

python3 test_DIST_1 ./Instances_genome/Inst_0000010_44.adn

Documentation

Vous y trouverez toutes les descriptions des fonctions et les détails du projet dans Rapport Projet.pdf.

Authors

• @KyroFRCode

License