merge

MANIFEST.in

@@ -0,0 +1 @@
+recursive-include src *.sql

README.md

@@ -1,38 +1,35 @@
 # Habref-api-module
 
-API d'interrogation d'Habref: référentiel des Habitat de l'INPN : https://inpn.mnhn.fr/telechargement/referentiels/habitats
+API d'interrogation d'Habref : référentiel des typologies d’habitats et de végétation pour la France (https://inpn.mnhn.fr/telechargement/referentiels/habitats).
 
-Technologies
-------------
+## Technologies
 
-* Python 3 
-* Flask
-* SqlAlchemy
+- Python 3
+- Flask
+- SQLAlchemy
 
-Installation
-------------
+## Installation
 
-* Créer un virtualenv et l'activer
+- Créer un virtualenv et l'activer :
 
-::
+```
+virtualenv -p /usr/bin/python3 venv
+source venv/bin/acticate
+```
 
-    virtualenv -p /usr/bin/python3 venv
-    source venv/bin/acticate
+- Installer le module :
 
-* Installer le module
+```
+pip install https://github.com/PnX-SI/Habref-api-module/archive/<X.Y.Z>.zip
+```
 
-::
-
-    pip install https://github.com/PnX-SI/Habref-api-module/archive/<X.Y.Z>.zip
+- Installer le schéma de base de données :
 
+Le module est fourni avec une commande pour installer la base de données. Cette commande télécharge le référentiel Habref et créé un schéma de base de données nommé ``ref_habitats``.
 
-* Installer le schéma de base de données
-
-Le module est fourni avec une commande pour installer la base de données. Cette commande télécharge le référentiel habref et crée un schéma de base de données nommé `ref_habitat`
-
-::
-
-    # depuis le virtualenv
-    install_habref_schema <database uri>
-    # ex:
-    # install_habref_schema "postgresql://geonatadmin:monpassachanger@localhost:5432/geonature2db"
+```
+# Depuis le virtualenv
+install_habref_schema <database uri>
+# Exemple :
+# install_habref_schema "postgresql://geonatadmin:monpassachanger@localhost:5432/geonature2db"
+```

VERSION

@@ -1 +1 @@
-0.0.2
+0.1.3

docs/changelog.rst

@@ -2,11 +2,39 @@
 CHANGELOG
 =========
 
-0.0.2 (2020-06-17)
+0.1.3 (2020-06-17)
 ------------------
 
-
 **🚀 Nouveautés**
 
 * Montée de la version de ``utils-flask-sqlalchemy``
 
+
+0.1.2 (2019-12-20)
+------------------
+
+**Corrections**
+
+* Correction erreur 500 lorsqu'un habitat n'a pas de correspondance
+
+0.1.1 (2019-12-18)
+------------------
+
+**Corrections**
+
+* Ajout des fichiers SQL d'installation du schéma ``ref_habitats`` dans le paquet
+* Montée de version de la librairie utils-Flask-SQLAlchemy
+
+0.1.0 (2019-12-17)
+------------------
+
+Première version stabilisée du sous-module Habref.
+
+* SQL de création d'un schéma ``ref_habitats`` contenant les données du référentiel HABREF 5.0
+* Commande python de création et d'import des données HABREF 
+* API d'interrogation du référentiel Habref :
+
+  - Recherche dans la table ``habref`` sur l'ensemble des champs
+  - Interrogation de la table ``typo_ref``
+  - Recherche d'informations sur un habitat et ses correspondances
+  - Interrogation auto-complétée et intelligente sur des listes d'habitats créées au préalable

src/pypn_habref_api/data/data_inpn_habref.sql

@@ -5,7 +5,7 @@ SET standard_conforming_strings = on;
 SET check_function_bodies = false;
 SET client_min_messages = warning;
 
-SET search_path = ref_habitat, pg_catalog;
+SET search_path = ref_habitats, pg_catalog;
 
 
 TRUNCATE TABLE habref CASCADE;
@@ -23,57 +23,57 @@ TRUNCATE TABLE habref_sources CASCADE;
 TRUNCATE TABLE cor_hab_source CASCADE;
 
 COPY bib_habref_typo_rel 
-FROM  '/tmp/habref/HABREF_TYPE_REL_40.csv'
+FROM  '/tmp/habref/HABREF_TYPE_REL_50.csv'
 WITH  CSV HEADER 
 DELIMITER E';'  encoding 'UTF-8';
 
 COPY bib_habref_statuts 
-FROM  '/tmp/habref/HABREF_STATUTS_40.csv'
+FROM  '/tmp/habref/HABREF_STATUTS_50.csv'
 WITH  CSV HEADER 
 DELIMITER E';'  encoding 'UTF-8';
 
 COPY habref_sources 
-FROM  '/tmp/habref/HABREF_SOURCES_40.csv'
+FROM  '/tmp/habref/HABREF_SOURCES_50.csv'
 WITH  CSV HEADER 
 DELIMITER E';'  encoding 'UTF-8';
 
 COPY typoref 
-FROM '/tmp/habref/TYPOREF_40.csv' 
+FROM '/tmp/habref/TYPOREF_50.csv' 
 WITH  CSV HEADER 
 DELIMITER E';'  encoding 'UTF-8';
 
 COPY habref 
-FROM '/tmp/habref/HABREF_NOHTML_40.csv' 
+FROM '/tmp/habref/HABREF_NOHTML_50.csv' 
 WITH  CSV HEADER 
 DELIMITER E';'  encoding 'UTF-8';
 
 COPY habref_corresp_hab
-FROM  '/tmp/habref/HABREF_CORRESP_HAB_40.csv'
+FROM  '/tmp/habref/HABREF_CORRESP_HAB_50.csv'
 WITH  CSV HEADER 
 DELIMITER E';'  encoding 'UTF-8';
 
 COPY habref_corresp_taxon 
-FROM  '/tmp/habref/HABREF_CORRESP_TAXON_40.csv'
+FROM  '/tmp/habref/HABREF_CORRESP_TAXON_50.csv'
 WITH  CSV HEADER 
 DELIMITER E';'  encoding 'UTF-8';
 
 COPY cor_habref_terr_statut 
-FROM  '/tmp/habref/HABREF_TERR_40.csv'
+FROM  '/tmp/habref/HABREF_TERR_50.csv'
 WITH  CSV HEADER 
 DELIMITER E';'  encoding 'UTF-8';
 
 COPY typoref_fields 
-FROM  '/tmp/habref/TYPOREF_FIELDS_40.csv'
+FROM  '/tmp/habref/TYPOREF_FIELDS_50.csv'
 WITH  CSV HEADER 
 DELIMITER E';'  encoding 'UTF-8';
 
 COPY cor_habref_description 
-FROM  '/tmp/habref/HABREF_DESCRIPTION_NOHTML_40.csv'
+FROM  '/tmp/habref/HABREF_DESCRIPTION_NOHTML_50.csv'
 WITH  CSV HEADER 
 DELIMITER E';'  encoding 'UTF-8';
 
 COPY cor_hab_source 
-FROM  '/tmp/habref/HABREF_LIEN_SOURCES_40.csv'
+FROM  '/tmp/habref/HABREF_LIEN_SOURCES_50.csv'
 WITH  CSV HEADER 
 DELIMITER E';'  encoding 'UTF-8';
 
@@ -90,12 +90,12 @@ ALTER TABLE cor_habref_description DROP COLUMN lb_hab_field;
 
 -- CREATE TABLE AUTOCOMPLETE
 
-INSERT INTO ref_habitat.autocomplete_habitat
+INSERT INTO ref_habitats.autocomplete_habitat
 SELECT 
 cd_hab,
 h.cd_typo,
 lb_code,
 lb_nom_typo,
 concat(lb_code, ' - ', lb_hab_fr, ' ', lb_hab_fr_complet)
-FROM ref_habitat.habref h
-JOIN ref_habitat.typoref t ON t.cd_typo = h.cd_typo;
+FROM ref_habitats.habref h
+JOIN ref_habitats.typoref t ON t.cd_typo = h.cd_typo;