NBI-Online

An online NBI Image Generator designed for doctors who don't have much knowledge about image processing.

NBI-Online 一个在线合成和管理NBI医用图片的免费工具网站

服务器重启后处理流程

首先，启动服务器，尝试重启网卡 ifconfig eno1 down ifconfig eno1 up sudo /sbin/dhclient sudo ifconfig 然后使用networkmanager，这个之前已经安装过了，不过可能重启之后没有自启动 输入 sudo systemctl status NetworkManager 看看是否是active的状态，如果不是，则 sudo systemctl start NetworkManager 然后启动网站 先启动mongodb mongodb不是用apt安装的，所以直接在/usr/local/mongodb/bin目录下执行 mongod --config /usr/local/mongodb/etc/mongodb.conf 然后运行mybin目录下的startTestServer.sh查看是否能正常启动，能则Ctrl+C停止，并运行startAtBackend.sh

排查服务器自动关机

syslog没找到原因，现场没有保存 怀疑是自动休眠的问题，长期无人访问而关机 于是 sudo systemctl mask sleep.target suspend.target hibernate.target hybrid-sleep.target 关闭自动休眠，先看看这个有没有效果

安装注意事项

需要使用node.js及其npm工具进行必要工具包的安装 前端采用vue.js实现，后端采用Django实现

在安装好django,node.js等必要组件后，在frontend文件夹下运行

npm i vue-router@3

npm i element-ui -S

npm install axios

npm run build ！注意：pymongo一定不要默认安装最新版本，安装pip install pymongo==3.11.3

系统搭建

一、系统分析

1、项目需求

• 支持上传一组图片：共三张图片（属于同一类的不同的两种图层用户之后的合成）并将合成的图片存储到本地
• 支持对图片的亮度调节并进行保存
• 对已上传图片的关联
• TODO：对批量上传图片的支持
• 对用户个人信息进行管理，包括完善和补充个人信息
• 将用户分为高级用户和初级用户，不同等级的用户将拥有不同的操作权限，用户可以通过一系列的方式成为高级用户
• TODO：对一组图片进行附加信息的管理，同时用户可以查看历史提交数据并进行管理

2、功能模块

• 单组图片上传以及处理模块：支持用户上传一组图片，快速反应生成一张NBI图片
• TODO：批处理模块，用户通过一定的规则批量上传图片数据
• 用户注册登录模块：通过邮箱验证注册，以及登录（！目前邮件验证并未开启，可以随便注册）
• 用户个人信息管理模块：负责用户完善和补充个人信息，以及管理高级用户和初级用户（管理包括高级用户如何获取，当前身份等等）
• 历史提交数据查看和管理模块，对于历史提交过的数据进行增删改查

2. 系统实现

1、项目结构

• NBI-Online：项目文件夹
  • conf：外部配置参数文件夹，配置参数以yaml格式存储
  • front：前端文件夹，基于Vue实现
    • dist：自动生成文件，在完全开启后端服务器上部署时，需使用npm run build生成
    • public：html文件
    • src：主要开发的资源文件
      • assets：前端静态资源
      • components：前端组件
      • pages：前端分页组件
      • router：Vue路由文件
  • myBin各种自定义的shell文件夹
  • NBIOnline：后端文件夹，基于Django实现
    • NBIOnline
      • dataManagement：本项目使用mongodb管理数据信息，数据管理相关脚本
      • ImageProcess：NBI图片处理相关脚本
      • UserManagement：用户管理相关脚本
    • static：后端静态资源文件
      • img：前端图片静态资源
      • Data：图片实际的存放位置，数据库中仅仅记录图片名称
        • Blue：蓝色波段图片
        • Green：绿色波段图片
        • NBI：最终生成的NBI图片（无压缩）
        • Temp：供前端展示的高压缩图片
        • White：白色光源下的标本图片，TODO尝试使用这个图片来自动矫正通道强度
        • Batch：刚刚解压缩的图片临时存放地，经过检查后图片不会存放在这里 TODO尝试在检查的时候将图片自动识别成组
      • js

2、数据库表

用户表

用户信息表: UserInfo

字段名	类型	含义
UID	String	email地址
pwd	String	md5加密后的密码
registerTime	Time	注册时间
name	String	用户昵称（初始为随机）
expiresTime	Time	高级用户过期时间戳
workPlace	String	用户工作单位（初始为空）
department	String	用户工作部门（初始为空）
competent	String	用户职称（初始为空）
inviteCode	String	邀请码
isSend	Boolean	是否已经赠送过邀请码？true表示已经赠送（每人赠送一次，可多次接受）
SUM_generate	Integer	记录用户生成的总NBI张数
TIMES_generate	Integer	可生成NBI图片数，超级用户为不限，也为10，但是上传时不会减少，普通用户为10

Token表

用户token表：TokenInfo

字段名	类型	含义
UID	String	email地址
expiresTime	Time	token过期时间
token	String	token值
lastLoginTime	Time	上一次登录的时间

图片信息表

图片生成信息表：PhotoInfo

字段名	类型	含义
UID	String	图片提交者的UID
Image_Green	String	绿光图片名
Image_White	String	白光图片名(可以为空)
Image_Blue	String	蓝光图片名
Image_Result	String	NBI合成图片名
Image_Compress	String	NBI合成后的压缩图片名(这个供前端展示)
uploadTime	Time	源图片上传时间
lastChangeTime	Time	上一次的修改时间
expireTime	Time	图片数据自动删除的时间，None则表示永久保存
isAutoBrightness	Boolean	最后一次生成时是否自动调节亮度
isGenerated	Boolean	是否点击了生成按钮，没有的则默认保留24小时
contrast	Integer	最后一次生成时的对比度
brightness	Integer	最后一次生成时的亮度
saturation	Integer	最后一次生成时的饱和度
luminosity	Integer	最后一次生成时的明度
channelOffset	Integer	最后一次生成时的通道调整值
isBatch	Boolean	是否是批处理提交的图片，如果是批处理的图片则不在单张的History里面展示

图片附加信息表

图片附加信息表：PhotoAdditionInfo

字段名	类型	含义
GID	String	图片的_id
sampleName	String	标本名
part	String	标本部位名
preDiagnosis	String	预诊断结论，可多选， 多选用‘,’分隔
remark	String	标本备注信息，随意输入
pathologic	String	病理诊断结论，可多选， 多选用‘,’分隔
differentiation	String	分化程度多选：“不适用” “低分化” “中分化” “高分化” 多选用‘,’分隔
infiltration	String	浸润深度：单选 “粘膜上皮层” “粘膜固有层” “粘膜肌层” “粘膜下层+文本录入（单位μm）”，“固有肌层”
cuttingEdge	Boolean	水平切缘 1-阳性；2-阴性

批处理批次信息表

批处理批次信息表：BatchProcess

字段名	类型	含义
UID	String	图片提交者的UID
batchName	String	批次的名称
srcFolderName	String	存放原始图片数据的文件夹名称，其组成为{batchName}_{uid}{rand}
uploadTime	Time	这一批次的上传完成的时间
checkTime	Time	这一批次的解压缩、检查完成（通过或不通过）的时间
finishTime	Time	这一批次的处理完成（处理错误）时间
expireTime	Time	这一批次的过期时间
imgList	String	这一批次所有图片的_id，字符串形式，中间用','分割，其中每条数据是元组的形式
batchSize	Integer	这一批次的图片组数
processedNum	Integer	这一批次已经处理的图片组数
status	Integer	这一批次的处理状态，1-上传中；2-检查中；3-检查失败；4-检查成功；5-处理中；6-处理完成