Skip to content

Open Data Aggregation & Knowledge Base Repository for the evolution of the SARS-COV-2 pandemic in Greece.

License

Notifications You must be signed in to change notification settings

akritiko/covid19gr

Repository files navigation

DOI

(click here to view an english version of the page 🇬🇧)

COVID19gr - Αποθετήριο συνάθροισης δεδομένων και Βάση Γνώσης για τον COVID-19 στην Ελλάδα

Αποθετήριο δεδομένων για την εξέλιξη της πανδημίας SARS-COV-2 στην Ελλάδα. Το αποθετήριο ανανεώνεται καθώς η πανδημία εξελίσσεται.

1. Δομή του αποθετηρίου.

Το αποθετήριο περιλαμβάνει:

1.1. Σύνολα δεδομένων

Διαθέσιμα σε μηχαναγνώσιμη μορφή, που ενημερώνονται τακτικά:

ΣΗΜΕΙΩΣΕΙΣ:

  • Τα προαναφερθέντα σύνολα δεδομένων δημιουργήθηκαν και συντηρούνται, ως επι το πλέιστον, είτε από την ευγενική πρωτοβουλία συμπολιτών μας οι οποίοι τα διαθέτουν κάτω από άδειες ανοικτών δεδομένων, και φυσικά εντελώς δωρεάν, είτε από μεγάλους φορείς (ερευνητικά κέντρα, εταιρίες, κ.ο.κ.). Στην συνέχεια θα βρείτε μια αναλυτική παρουσίαση για τις πηγές δεδομένων.
  • Τα ημερήσια στοιχεία (λ.χ. κρούσματα, απώλειες, κ.ο.κ.) αντιστοιχούν στο χρόνο ανακοίνωσης από την Ελληνική Κυβέρνηση και όχι στον χρόνο τέλεσης των συμβάντων. Για περισσότερες πληροφορίες σας προτρέπουμε να ελέγχετε τις διευκρινήσεις των δημιουργών του εκάστοτε συνόλου δεδομένων (βλ. παρακάτω).

1.2. Αναφορές

Αποδελτίωση αναφορών σχετικά με την εξέλιξη της πανδημίας του νέου κορονοϊού στην Ελλάδα. Πιο συγκεκριμένα η συλλογή καταγράφει:

  1. Την ημερήσια αναφορά του Εθνικού Οργανισμού Δημόσιας Υγείας (Ε.Ο.Δ.Υ) σε μορφότυπο .PDF.
  2. Την ενημέρωση από το Υπ. Υγείας και το Υπ. Πολιτικής Προστασίας σε μορφή video στο Youtube.
  3. Την περιοδική αναφορά των ελέγχων για την τήρηση των μέτρων από την Εθνική Αρχή Διαφάνειας σε μορφότυπο .html.

Οι παραπάνω πηγές συναθροίζονται, σε επίπεδο συνδέσμων (hyperlinks), σε ένα λογιστικό φύλλο και διατίθενται ελευθερα και ανοικτά προς χρήση και επεξεργασία σε μορφότυπο .CSV, .JSON και Google Spreadsheet (μόνο για ανάγνωση)

ΣΗΜΕΙΩΣΕΙΣ:

  • Πολλά σύνολα δεδομένων αποτελούν προϊόν συνδυασμού διαφορετικών πηγών πρωτογενών δεδομένων. Σας προτείνουμε λοιπόν για τον καλύτερο δυνατό έλεγχο να αναφέρεστε στις πηγές δεδομένων που θα βρείτε στην συνέχεια, σχετικά με τον τρόπο δημιουργίας του εκάστοτε συνόλου δεδομένων.
  • Οι αναφορές σε .pdf μορφή από 17/12/2020 έχουν σταματήσει να είναι διαθέσιμες για λόγους οικονομίας μεγέθους του αποθετηρίου.

1.3. Επισκόπηση του πλαισίου Ανοικτών Δεδομένων στην Ελλάδα ( archived )

Μπορείτε να βρείτε την τελευταία διαθέσιμη έκδοση του πλαισίου εδώ (διαθέσιμό μόνον στα ελληνικά).

1.4. Resources

Μια καταγραφή πόρων και εργαλείων που βοηθούν στην παρακολούθηση της κατάστασης της πανδημίας COVID-19. Δεν σχετίζονται απαραίτητα με τα σύνολα δεδομένων αυτού του αποθετηρίου. Πιο συγκεκριμένα είναι διαθέσιμες οι ακόλουθες συλλογές:

  1. Data related
  2. Guides
  3. Applications

1.5. References

Μια καταγραφή επιστημονικών δημοσιεύσεων και μελετών επίσημων διεθνων φορέων για την πανδημία COVID-19. Η συλογή περιλαμβάνει αναφορές που αφορούν επιστημες της υγείας, επιδημιολογία, κοινωνιολογία, τεχνολογία και θα ανανεώνεται όποτε το επιτρέπει ο χρόνος μας.

Όλες οι αναφορές διαθέσιμες εδώ.

1.6. Ενωποιημένο σχήμα Ανοικτών Δεδομένων

Καθώς ένας από τους βασικούς σκοπούς του απωθετηρίου είναι η συνάθροιση των ανοικτών δεδομένων που προέρχονται από διάφορες πηγές και εθελοντές, για την συνδυαστική και αποτελεσματική μελέτη τους είναι απαραίτητη η δημιουργία ενός σχήματος δεδομένων που θα μπορεί να αποσαφηνίζει τα δεδομένα του κάθε συνόλου δεδομένων και θα βοηθά τον ενδιαφερόμενο να κατανοεί καλύτερα τα δεδομένα αυτά. Στην συνέχεια θα βρείτε το σχήμα δεδομένων και ένα online δωρεάν εργαλείο που θα σας επιτρέψει να το προσπελάσετε σε μια πιο απλή, οπτικοποιημένη μορφή.

ΟΔΗΓΟΣ: Πως χρησιμοποιώ το Data Package Creator για να προσπελαύνω το Σχήμα Ανοικτών Δεδομένων covid19gr.

2. Σύνολα δεδομένων που φιλοξενούνται στο αποθετήριο COVID19gr

Μπορείτε να βρείτε αναλυτικές πληροφορίες για όλα τα σύνολα δεδομένων που φιλοξενούνται σε αυτό το αποθετήριο σε αυτό το Google Document (διαθέσιμο μόνο για ανάγνωση). Παρέχονται τα εξής μεταδεδομένα:

  • ID (αύξων αριθμός)
  • Τίτλος σετ δεδομένων
  • Όνομα αρχείου
  • Τύπος πηγής δεδομένων
  • Μορφότυπος αρχείου
  • Κατηγορία δεδομένων
  • Περιοχή αναφοράς
  • Δημιουργός του σετ δεδομένων
  • Ιστοσελίδα του δημιουργού
  • Εταιρεία / Οργανισμός με τον οποίο σχετίζεται ο δημιουργός
  • Σύνδεσμος πηγαίων δεδομένων
  • Σύνδεσμος οπτικοποίησης των δεδομένων
  • Άδεια χρήσης των δεδομένων
  • Ημερομηνία τελευταίας ενημέρωσης
  • 5 Star Open Data Score

2.1. Επιδημιολογικά Δεδομένα

  • Ημερήσιες μετρήσεις (διάφοροι δείκτες) - Πανελλαδικά (σύνολα)
  • Περιστατικά Ανδρών (συνολικά), ανά ηλικιακή ομάδα & σοβαρότητα περιστατικού
  • Περιστατικά Ανδρών (ημερήσια), ανά ηλικιακή ομάδα & σοβαρότητα περιστατικού
  • Περιστατικά γενικού πληθυσμού (συνολικά), ανά ηλικιακή ομάδα & σοβαρότητα περιστατικού
  • Περιστατικά γενικού πληθυσμού (ημερήσια), ανά ηλικιακή ομάδα & σοβαρότητα περιστατικού
  • Περιστατικά Γυναικών (συνολικά), ανά ηλικιακή ομάδα & σοβαρότητα περιστατικού
  • Περιστατικά Γυναικών (ημερήσια), ανά ηλικιακή ομάδα & σοβαρότητα περιστατικού
  • Προβλέψεις
  • Ημερήσιες μετρήσεις (διάφοροι δείκτες) - Ανά νομό
  • Ημερήσιες μετρήσεις (διάφοροι δείκτες) - Ανά περιφέρεια
  • Ημερήσιες μετρήσεις (διάφοροι δείκτες) - Πανελλαδικά
  • Ημερήσιες μετρήσεις (κρούσματα) - Ανά Περιφέρεια
  • μερήσιες μετρήσεις (απώλειες) - Ανά Περιφέρεια
  • Πληροφορίες για σχολεία
  • Περιστατικά COVID-19 ανά περιφέρεια και στάδιο νοσηλείας
  • Δεδομένα ελέγχων Rapid Tests

2.2. Δεδομένα Κινητικότητας

  • Περιοδική κινητικότητα* ανά αποκεντρωμένη περιφέρεια και δραστηριότητα από Google για το έτος 2020

  • Περιοδική κινητικότητα* ανά αποκεντρωμένη περιφέρεια και δραστηριότητα από Google για το έτος 2021

  • Ημερήσια κινητικότητα σε επίπεδο χώρας από Apple

  • Ημερήσια κινητικότητα για Αθήνα και Θεσσαλονίκη από TomTom | Σημειώσεις επί των συνόλων δεδομένων

  • *Τα δεδομένα κινητικότητας της Google δεν βγαίνουν σε ημερήσια βάση αλλά τακτικά (κάθε 2 ημέρες κατά Μ.Ο. περίπου). Είναι όμως το μοναδικό dataset που διαχωρίζει τα δεδομένα ανά δραστηριότητα (λιανική, πάρκα, χώροι εργασίας, κλπ.). Τα reports της Google θα είναι διαθέσιμα για χρήση με στόχο την καταπολέμηση της πανδημίας για όσο κρίνεται ότι βοηθούν την παγκόσμια κοινότητα στο να λάβει τις κατάλληλες αποφάσεις. Δεν δίδεται δηλαδή κάποια ξεκάθαρη άδεια χρήσης, αλλά αποτελούν δεδομένα δημόσια διαθέσιμα για την καταπολέμηση της πανδημίας.

  • Τα δεδομένα της Apple αφορούν στο σύνολο της χώρας και τα λαμβάνουμε από το αποθετήριο COVID19_mobility του χρήστη ActiveConclusion που διατίθεται κάτω από άδεια χρήσης MIT license.

  • Τα δεδομένα της TomTom αφορούν τις πόλεις Αθήνα και Θεσσαλονίκη και τα λαμβάνουμε από το αποθετήριο COVID19_mobility του χρήστη ActiveConclusion που διατίθεται κάτω από άδεια χρήσης MIT license.

2.3. Δεδομένα που αφορούν τα μέτρα αποστασιοποίησης & τον έλεγχο αυτών

  • Αποτίμηση ελέγχων covid-19 (Εθνική Αρχή Διαφάνειας)
  • Δείκτης ρίσκου τερματισμού των μέτρων αποστασιοποίησης
  • Δείκτης αυστηρότητας κυβερνητικών μέτρων

Σημειώσεις επί των συνόλων δεδομένων

  • Τα δεδομένα από την Εθνική Αρχή Διαφάνειας βρίσκονται στην αρχή τους μορφή εδώ. Συντηρώ το σετ δεδομένων προσωπικά οπότε εάν βρέιτε λάθη ή αστοχίες σας παρακαλώ να με ενημερώσετε με τους τρόπους που αναφέρουμε παρακάτω, ώστε να κάνω τις απαραίτητες διορθώσεις.
  • Τα σετ δεδομένων του Oxford Covid-19 Government Response Tracker αφορούν σε επιστημονική εργασία της συγκεκριμένης ομάδας. Στο αποθετήριο αυτό θα βρείτε τα CSV με τις τελικές μετρήσεις όμως, πριν τις χρησιμοποιήσετε είναι καλό να συμβουλευτείτε την βιβλιογραφία της ερευνητικής ομάδας στον επίσημο ιστότοπό τους. Διατίθενται κάτω από άδεια Creative Commons Attribution 4.0 International.

2.4. Δεδομένα που αφορούν τους εμβολιασμούς

  • Εμβολιασμοί - Πανελλαδικά
  • Εμβολιασμοί - Ανά Περιοχή (Ελλάδα)
  • Εμβολιασμοί - Δεδομένα ECDC

Σημειώσεις επί των συνόλων δεδομένων

2.5. Αρχείο επίσημων αναφορών (urls)

  • Επίσημες αναφορές

Σημειώσεις επί των συνόλων δεδομένων

  • Το σύνολο δεδομένων περιλαμβάνει αναφορές από: ΕΟΔΥ (καθημερινά δελτία τύπου), Παρατηρητήριο COVID-19 (περιοδικές αναφορές), Εθνική Αρχή Διαφάνειας - Έλεγχοι τήρησης μέτρων (περιοδική αναφορά), Clipnews Top Level Report - Επισκόπηση επικαιρότητας για τον κορονοϊό (περιοδική αναφορά).
  • Για την εξαγωγή των δεδομένων χρησιμοποιήθηκε το εργαλείο DEiXTo με το οποίο έγινε ένα και μοναδικό parse ανά site.

ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Σε περίπτωση που κάποιο από τα URLs οδηγεί σε σελίδα χωρίς περιεχόμενο ή σε σελίδα με σφάλμα 404, προτείνω να αναζητήσετε το περιεχόμενο μέσω της Wayback Machine του Inernet Archive. Τα βήματα είναι τα εξής:

  1. Επιλέγετε τον σύνδεσμο του report που δεν είναι διαθέσιμος (λ.χ. https://eody.gov.gr/wp-content/uploads/2020/03/covid-gr-daily-report-20200320.pdf που αντιστοιχεί στο ημερήσιο report του ΕΟΔΥ για την ημερομηνία 20-03-2020).
  2. Επισκέπτεστε την Wayback Machine του Internet Archive (κλικ στον σύνδεσμο).
  3. Επικολλάτε την διεύθυνση του βήματος ένα στο πλαίσιο αναζήτησης.
  4. Στο ημερολόγιο που θα σας εμφανίσει επιλέγεται ένα από τα κυκλάκια και κάνετε κλικ στην ημερομηνία και ώρα ώστε να σας φορτώσει την αναφορά.

2.6. Βοηθητικά σετ δεδομένων για την ανάλυση των δεδομένων

  • Ελληνικές Περιφέρειες
  • Δεδομένα Περιόδων Lockdown |

2.7. Νομοθεσία

  • Νομοθεσία COVID-19
  • Νομοθεσία COVID-19 - Πανδέκτης

2.8. Οικονομία

  • Δεδομένα Ανεργίας

Σημειώσεις επί των συνόλων δεδομένων

3. Άδεια χρήσης των πληροφοριών του COVID19gr

Τα δεδομένα είναι δύναμη. Σε καιρούς κρίσεων μάλιστα, εάν χρησιμοποιηθούν σωστά μπορούν να κάνουν τη διαφορά προστατεύοντας τους συμπολίτες μας. Έχοντας αυτά σαν βασικές σκέψεις δημοσιεύουμε το περιεχόμενο αυτού του αποθετηρίου, εκτός αν αναφέρεται ρητά κάτι διαφορετικό σε κάποιο σημείο, κάτω από άδεια: Κοινό Κτήμα / Public Domain: CC0-1.0.

4. Αναφορά Προβλημάτων & Πληροφορίες

Σε περίπτωση που εντοπίσετε κάποιο λάθος, έχετε κάποια ιδέα ή απορία που θέλετε να μοιραστείτε μαζί μας μπορείτε να το κάνετε χρησιμοποιώντας τον μηχανισμό υπολοβολής προτάσεων του αποθετηρίου. Θα σας απαντήσουμε το συντομότερο δυνατό.

6. Αναγνώριση & Ευχαριστίες

Το αποθετήριο αυτό δεν είναι τίποτε άλλο παρά μία συλλογή από σετ δεδομένων. Για τα σύνολα δεδομένων που περιλαμβάνει εργάσθηκαν οι εξής:

7. Πως να αναφερθείτε σε αυτό το αποθετήριο (προαιρετικά)

Καθώς το αποθετήριο προσφέρεται κάτω από άδεια Κοινού Κτήματος CC0-1.0, δεν έχετε καμία απολύτως υποχρέωση να κάνετε κανενός είδους αναφοράς. Εάν παρόλα αυτά θέλετε να κάνετε κάποια αναφορά θα μπορούσατε να χρησιμοποιήσετε την παρακάτω μορφή:

Apostolos Kritikos. (2021). akritiko/covid19gr: Diogenes (4.0.0). Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.5651141

ή σε μορφή BibTEX version.