TMF School 2022

Materialien zur TMF School 2022 in Rauischholzenhausen

1. Zusammenfassung und Jeopardy!

• Folien
• Beispielvideo auf Youtube (old school): https://www.youtube.com/watch?v=ipHoqG0rcXw

2. Übung zu Datenformaten

ClinFHIR ist ein Werkzeug zur Modellierung von FHIR-Ressourcen auf öffentlichen FHIR-Servern mit Anwenderschwerpunkt "Kliniker"

• Link zu ClinFHIR: http://clinfhir.com/
• Folien zur Übung

3. Übung zu Terminologien

"Annotool" ist ein prototypisches Werkzeug zur Annotierung von Datenelementen mit Codes aus medizinischen Terminologien aus dem SMITH-Konsortium

• Link zur Annotool-Instanz für die Übungen: http://nisa3zjndxmyk33y.myfritz.net:8103/
  • Login: Mailadresse, die bei der Anmeldung zur TMF-School angegeben wurde
  • Passwort: demo
  • Beispieldatensatz aus dem POLAR_MI Use Case der MII
• Folien zur Übung

4. Übung zu metadatengetriebener Datenextraktion

FAIR4Health Data Curation Tool: Ein Werkzeug zur Umwandlung von CSV-Daten in FHIR-Ressourcen

• Data Curation Tool: Download zur Installation
• FHIR-Server: gezippte Variante mit benötigten Profilen
• Demodatensatz mit Patienten, Fällen, Diagnosem Laborwerten, Medikationen in getrennten Tabellen
• Folien zur Übung
• Handbuch zum Demodatensatz (englisch, Deliverable des EU-Projekts)