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@larmarange
larmarange committed Dec 18, 2023
1 parent 6726cf4 commit a5b3c58
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Showing 34 changed files with 172 additions and 179 deletions.
2 changes: 1 addition & 1 deletion docs/analyses/contrastes.html
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Expand Up @@ -5993,7 +5993,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-contrastes" class="quarto-section-identifier"><s
</ul>
</div>
</div>
</footer><script>var lightboxQuarto = GLightbox({"openEffect":"zoom","descPosition":"bottom","selector":".lightbox","loop":true,"closeEffect":"zoom"});</script>
</footer><script>var lightboxQuarto = GLightbox({"closeEffect":"zoom","openEffect":"zoom","selector":".lightbox","descPosition":"bottom","loop":true});</script>


<script src="../site_libs/quarto-html/zenscroll-min.js"></script>
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26 changes: 13 additions & 13 deletions docs/analyses/estimations-marginales.html
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16 changes: 8 additions & 8 deletions docs/analyses/ggplot2.html
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Expand Up @@ -576,7 +576,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-ggplot2" class="quarto-section-identifier"><span
</h2>
<p><a href="https://ggplot2.tidyverse.org">ggplot2</a> nécessite que les données du graphique soient sous la forme d’un tableau de données (<em>data.frame</em> ou <em>tibble</em>) au format <em>tidy</em>, c’est-à-dire avec une ligne par observation et les différentes valeurs à représenter sous forme de variables du tableau.</p>
<div id="fig-grammaire-graphiques" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ressources/ggplot-grammar-of-graphics.png" class="lightbox" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-1" title="La grammaire des graphiques"><img src="ressources/ggplot-grammar-of-graphics.png" class="img-fluid figure-img"></a></p>
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ressources/ggplot-grammar-of-graphics.png" class="lightbox" title="La grammaire des graphiques" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-1"><img src="ressources/ggplot-grammar-of-graphics.png" class="img-fluid figure-img"></a></p>
<figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;17.1: La grammaire des graphiques</figcaption></figure>
</div>
<p>Tous les graphiques avec <a href="https://ggplot2.tidyverse.org">ggplot2</a> suivent une même logique. En <strong>premier</strong> lieu, on appellera la fonction <code><a href="https://ggplot2.tidyverse.org/reference/ggplot.html">ggplot2::ggplot()</a></code> en lui passant en paramètre le fichier de données.</p>
Expand All @@ -596,7 +596,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-ggplot2" class="quarto-section-identifier"><span
<span id="cb1-10"><a href="#cb1-10"></a>p</span></code><button title="Copier vers le presse-papier" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
<div class="cell-output-display page-columns page-full">
<div id="fig-exemple-simple-ggplot2" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ggplot2_files/figure-html/fig-exemple-simple-ggplot2-1.png" class="lightbox" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-2" title="Un exemple simple de nuage de points avec ggplot2"><img src="ggplot2_files/figure-html/fig-exemple-simple-ggplot2-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ggplot2_files/figure-html/fig-exemple-simple-ggplot2-1.png" class="lightbox" title="Un exemple simple de nuage de points avec ggplot2" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-2"><img src="ggplot2_files/figure-html/fig-exemple-simple-ggplot2-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;17.2: Un exemple simple de nuage de points avec <code>ggplot2</code></figcaption></figure>
</div>
</div>
Expand Down Expand Up @@ -650,7 +650,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-ggplot2" class="quarto-section-identifier"><span
<span id="cb2-24"><a href="#cb2-24"></a> )</span></code><button title="Copier vers le presse-papier" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
<div class="cell-output-display page-columns page-full">
<div id="fig-exemple-avance-ggplot2" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ggplot2_files/figure-html/fig-exemple-avance-ggplot2-1.png" class="lightbox" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-3" title="Un exemple avancé de nuage de points avec ggplot2"><img src="ggplot2_files/figure-html/fig-exemple-avance-ggplot2-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ggplot2_files/figure-html/fig-exemple-avance-ggplot2-1.png" class="lightbox" title="Un exemple avancé de nuage de points avec ggplot2" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-3"><img src="ggplot2_files/figure-html/fig-exemple-avance-ggplot2-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;17.3: Un exemple avancé de nuage de points avec <code>ggplot2</code></figcaption></figure>
</div>
</div>
Expand All @@ -671,23 +671,23 @@ <h1 class="title"><span id="sec-ggplot2" class="quarto-section-identifier"><span
</h2>
<p>Le package <a href="https://dreamrs.github.io/esquisse/">esquisse</a> propose un <em>addin</em> offrant une interface visuelle pour la création de graphiques <a href="https://ggplot2.tidyverse.org">ggplot2</a>. Après installation du package, on pourra lancer <a href="https://dreamrs.github.io/esquisse/">esquisse</a> directement à partir du menu <em>addins</em> de <strong>RStudio</strong>.</p>
<div id="fig-lancement-esquisse" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ressources/esquisse-launch-addin.png" class="lightbox" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-4" title="Lancement d’esquisse à partir du menu Addins de RStudio"><img src="ressources/esquisse-launch-addin.png" class="img-fluid figure-img"></a></p>
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ressources/esquisse-launch-addin.png" class="lightbox" title="Lancement d’esquisse à partir du menu Addins de RStudio" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-4"><img src="ressources/esquisse-launch-addin.png" class="img-fluid figure-img"></a></p>
<figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;17.5: Lancement d’<code>esquisse</code> à partir du menu <em>Addins</em> de <strong>RStudio</strong></figcaption></figure>
</div>
<p>Au lancement de l’<em>addin</em>, une interface permettra de choisir le tableau de données à partir duquel générer le graphique. Le plus simple est de choisir un tableau présent dans l’environnement. Mais <a href="https://dreamrs.github.io/esquisse/">esquisse</a> offre aussi la possibilité d’importer des fichiers externes, voir de procéder à quelques modifications des données.</p>
<div id="fig-esquisse-import-donnees" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ressources/esquisse-import-data.png" class="lightbox" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-5" title="Import de données au lancement d’esquisse"><img src="ressources/esquisse-import-data.png" class="img-fluid figure-img"></a></p>
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ressources/esquisse-import-data.png" class="lightbox" title="Import de données au lancement d’esquisse" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-5"><img src="ressources/esquisse-import-data.png" class="img-fluid figure-img"></a></p>
<figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;17.6: Import de données au lancement d’<code>esquisse</code></figcaption></figure>
</div>
<div class="page-columns page-full"><p>Le principe général d’<a href="https://dreamrs.github.io/esquisse/">esquisse</a> consiste à associer des variables à des esthétiques par glisser/déposer<a href="#fn2" class="footnote-ref" id="fnref2" role="doc-noteref"><sup>2</sup></a>. L’outil déterminera automatiquement une géométrie adaptée en fonction de la nature des variables (continues ou catégorielles). Un clic sur le nom de la géométrie en haut à gauche permet de sélectionner une autre géométrie.</p><div class="no-row-height column-margin column-container"><li id="fn2"><p><sup>2</sup>&nbsp;Si une esthétique n’est pas visible à l’écran, on pourra cliquer en haut à droite sur l’icône en forme de roue dentée afin de choisir d’afficher plus d’esthétiques.</p></li></div></div>
<div id="fig-esquisse-géométrie" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ressources/esquisse-geometries.png" class="lightbox" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-6" title="Choix d’une géométrie dans esquisse"><img src="ressources/esquisse-geometries.png" class="img-fluid figure-img"></a></p>
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ressources/esquisse-geometries.png" class="lightbox" title="Choix d’une géométrie dans esquisse" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-6"><img src="ressources/esquisse-geometries.png" class="img-fluid figure-img"></a></p>
<figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;17.7: Choix d’une géométrie dans <code>esquisse</code></figcaption></figure>
</div>
<p>Les menus situés en bas de l’écran permettent d’ajouter/modifier des étiquettes, de modifier certaines options du graphiques, de modifier les échelles de couleurs et l’apparence du graphique, et de filtrer les observations inclues dans le graphique.</p>
<p>Le menu <strong>Code</strong> permet de récupérer le code correspondant au graphique afin de pouvoir le copier/coller dans un script.</p>
<div id="fig-esquisse-code" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ressources/esquisse-controls-code.png" class="lightbox" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-7" title="Obtenir le code du graphique obtenu avec esquisse"><img src="ressources/esquisse-controls-code.png" class="img-fluid figure-img"></a></p>
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="ressources/esquisse-controls-code.png" class="lightbox" title="Obtenir le code du graphique obtenu avec esquisse" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-7"><img src="ressources/esquisse-controls-code.png" class="img-fluid figure-img"></a></p>
<figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;17.8: Obtenir le code du graphique obtenu avec <code>esquisse</code></figcaption></figure>
</div>
<p><a href="https://dreamrs.github.io/esquisse/">esquisse</a> offre également la possibilité d’exporter le graphique obtenu dans différents formats.</p>
Expand Down Expand Up @@ -1089,7 +1089,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-ggplot2" class="quarto-section-identifier"><span
</ul>
</div>
</div>
</footer><script>var lightboxQuarto = GLightbox({"closeEffect":"zoom","selector":".lightbox","openEffect":"zoom","loop":true,"descPosition":"bottom"});</script>
</footer><script>var lightboxQuarto = GLightbox({"selector":".lightbox","closeEffect":"zoom","openEffect":"zoom","loop":true,"descPosition":"bottom"});</script>


<script src="../site_libs/quarto-html/zenscroll-min.js"></script>
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2 changes: 1 addition & 1 deletion docs/analyses/interactions.html
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Expand Up @@ -2402,7 +2402,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-interactions" class="quarto-section-identifier">
</ul>
</div>
</div>
</footer><script>var lightboxQuarto = GLightbox({"descPosition":"bottom","loop":true,"openEffect":"zoom","selector":".lightbox","closeEffect":"zoom"});</script>
</footer><script>var lightboxQuarto = GLightbox({"descPosition":"bottom","openEffect":"zoom","selector":".lightbox","closeEffect":"zoom","loop":true});</script>


<script src="../site_libs/quarto-html/zenscroll-min.js"></script>
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2 changes: 1 addition & 1 deletion docs/analyses/likert.html
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Expand Up @@ -2672,7 +2672,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-likert" class="quarto-section-identifier"><span
</ul>
</div>
</div>
</footer><script>var lightboxQuarto = GLightbox({"closeEffect":"zoom","descPosition":"bottom","selector":".lightbox","openEffect":"zoom","loop":true});</script>
</footer><script>var lightboxQuarto = GLightbox({"loop":true,"selector":".lightbox","descPosition":"bottom","closeEffect":"zoom","openEffect":"zoom"});</script>


<script src="../site_libs/quarto-html/zenscroll-min.js"></script>
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4 changes: 2 additions & 2 deletions docs/analyses/multicolinearite.html
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Expand Up @@ -1309,7 +1309,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-multicolinearite" class="quarto-section-identifi
</div>
<div class="cell-output-display page-columns page-full">
<div id="fig-check_collinearity" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="multicolinearite_files/figure-html/fig-check_collinearity-1.png" class="lightbox" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-1" title="Représentation graphique des FIV d’un modèle"><img src="multicolinearite_files/figure-html/fig-check_collinearity-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="multicolinearite_files/figure-html/fig-check_collinearity-1.png" class="lightbox" title="Représentation graphique des FIV d’un modèle" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-1"><img src="multicolinearite_files/figure-html/fig-check_collinearity-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;27.1: Représentation graphique des FIV d’un modèle</figcaption></figure>
</div>
</div>
Expand Down Expand Up @@ -1708,7 +1708,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-multicolinearite" class="quarto-section-identifi
</ul>
</div>
</div>
</footer><script>var lightboxQuarto = GLightbox({"openEffect":"zoom","closeEffect":"zoom","loop":true,"selector":".lightbox","descPosition":"bottom"});</script>
</footer><script>var lightboxQuarto = GLightbox({"openEffect":"zoom","selector":".lightbox","loop":true,"closeEffect":"zoom","descPosition":"bottom"});</script>


<script src="../site_libs/quarto-html/zenscroll-min.js"></script>
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10 changes: 5 additions & 5 deletions docs/analyses/regression-lineaire.html
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Expand Up @@ -576,7 +576,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-regression-lineaire" class="quarto-section-ident
<span id="cb1-6"><a href="#cb1-6"></a> <span class="fu">theme_light</span>()</span></code><button title="Copier vers le presse-papier" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
<div class="cell-output-display page-columns page-full">
<div id="fig-rel-petal.width-petal.length" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="regression-lineaire_files/figure-html/fig-rel-petal.width-petal.length-1.png" class="lightbox" title="Relation entre la largeur et la longueur des pétales (nuage de points)" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-1"><img src="regression-lineaire_files/figure-html/fig-rel-petal.width-petal.length-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="regression-lineaire_files/figure-html/fig-rel-petal.width-petal.length-1.png" class="lightbox" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-1" title="Relation entre la largeur et la longueur des pétales (nuage de points)"><img src="regression-lineaire_files/figure-html/fig-rel-petal.width-petal.length-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;21.1: Relation entre la largeur et la longueur des pétales (nuage de points)</figcaption></figure>
</div>
</div>
Expand All @@ -591,7 +591,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-regression-lineaire" class="quarto-section-ident
<span id="cb2-6"><a href="#cb2-6"></a> <span class="fu">theme_light</span>()</span></code><button title="Copier vers le presse-papier" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
<div class="cell-output-display page-columns page-full">
<div id="fig-rel-petal.width-petal.length-lm" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="regression-lineaire_files/figure-html/fig-rel-petal.width-petal.length-lm-1.png" class="lightbox" title="Relation linéaire entre la largeur et la longueur des pétales" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-2"><img src="regression-lineaire_files/figure-html/fig-rel-petal.width-petal.length-lm-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="regression-lineaire_files/figure-html/fig-rel-petal.width-petal.length-lm-1.png" class="lightbox" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-2" title="Relation linéaire entre la largeur et la longueur des pétales"><img src="regression-lineaire_files/figure-html/fig-rel-petal.width-petal.length-lm-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;21.2: Relation linéaire entre la largeur et la longueur des pétales</figcaption></figure>
</div>
</div>
Expand Down Expand Up @@ -628,7 +628,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-regression-lineaire" class="quarto-section-ident
<span id="cb5-13"><a href="#cb5-13"></a> <span class="fu">theme_light</span>()</span></code><button title="Copier vers le presse-papier" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
<div class="cell-output-display page-columns page-full">
<div id="fig-rel-petal.width-petal.length-lm2" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="regression-lineaire_files/figure-html/fig-rel-petal.width-petal.length-lm2-1.png" class="lightbox" title="Relation linéaire entre la largeur et la longueur des pétales (représentation graphique de l’intercept)" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-3"><img src="regression-lineaire_files/figure-html/fig-rel-petal.width-petal.length-lm2-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="regression-lineaire_files/figure-html/fig-rel-petal.width-petal.length-lm2-1.png" class="lightbox" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-3" title="Relation linéaire entre la largeur et la longueur des pétales (représentation graphique de l’intercept)"><img src="regression-lineaire_files/figure-html/fig-rel-petal.width-petal.length-lm2-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;21.3: Relation linéaire entre la largeur et la longueur des pétales (représentation graphique de l’intercept)</figcaption></figure>
</div>
</div>
Expand Down Expand Up @@ -2260,7 +2260,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-regression-lineaire" class="quarto-section-ident
<span id="cb23-2"><a href="#cb23-2"></a><span class="fu">ggcoef_model</span>(mod)</span></code><button title="Copier vers le presse-papier" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
<div class="cell-output-display page-columns page-full">
<div id="fig-forest-plot-lm" class="quarto-figure quarto-figure-center anchored page-columns page-full">
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="regression-lineaire_files/figure-html/fig-forest-plot-lm-1.png" class="lightbox" title="un graphique en forêt des coefficients du modèle" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-4"><img src="regression-lineaire_files/figure-html/fig-forest-plot-lm-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figure class="figure page-columns page-full"><p><a href="regression-lineaire_files/figure-html/fig-forest-plot-lm-1.png" class="lightbox" data-gallery="quarto-lightbox-gallery-4" title="un graphique en forêt des coefficients du modèle"><img src="regression-lineaire_files/figure-html/fig-forest-plot-lm-1.png" class="img-fluid figure-img" width="672"></a></p>
<figcaption class="figure-caption margin-caption">Figure&nbsp;21.4: un graphique en forêt des coefficients du modèle</figcaption></figure>
</div>
</div>
Expand Down Expand Up @@ -2550,7 +2550,7 @@ <h1 class="title"><span id="sec-regression-lineaire" class="quarto-section-ident
</ul>
</div>
</div>
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