3.0.0 updates #1413

Job	Run time
pip (3.11, .)	42s
pip (3.11, .[actions])	44s
pip (3.11, .[docs])	49s
pip (3.12, .)	45s
pip (3.12, .[actions])	51s
pip (3.12, .[docs])	52s
docs	48s
CI	5m 37s
lint	45s
createEnvs (CONDA_SHARED_ENV)	2m 3s
createEnvs (CONDA_CREATE_INDEX_ENV)	1m 52s
createEnvs (CONDA_RNASEQ_ENV)	2m 2s
createEnvs (CONDA_RMATS_ENV)	1m 42s
createEnvs (CONDA_scRNASEQ_ENV)	2m 4s
createEnvs (CONDA_seurat3_ENV)	1m 15s
createEnvs (CONDA_loompy_ENV)	1m 36s
createEnvs (CONDA_alevinqc_ENV)	2m 11s
createEnvs (CONDA_eisaR_ENV)	2m 13s
createEnvs (CONDA_DNA_MAPPING_ENV)	2m 7s
createEnvs (CONDA_CHIPSEQ_ENV)	2m 3s
createEnvs (CONDA_ATAC_ENV)	1m 48s
createEnvs (CONDA_HIC_ENV)	2m 15s
createEnvs (CONDA_WGBS_ENV)	2m 8s
createEnvs (CONDA_DSS_ENV)	2m 20s
createEnvs (CONDA_RMD_ENV)	1m 46s
createEnvs (CONDA_PREPROCESSING_ENV)	1m 25s
createEnvs (CONDA_NONCODING_RNASEQ_ENV)	2m 19s
createEnvs (CONDA_SAMBAMBA_ENV)	1m 35s
createEnvs (CONDA_pysam_ENV)	1m 37s
	50m 14s

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