CardoiSpike

Задача определения ковидных аномаий по данным кардиинтервалографии

Установка зависимостей

pip install -r requirements.txt

Запуск

git clone https://github.com/mike-live/cardoispike.git
cd cardoispike/main
python run.py --data_path '../data/test.csv' --output_path 'output/' --output_filename "output.csv"

..data/test.csv - должен иметь следующий формат:

	id	time	x
0	81	0	576
1	81	568	568
2	81	1140	572
3	81	1716	576

Тогда 'output/output.csv' будет иметь вид:

	id	time	x	y
0	81	0	576	0
1	81	568	568	0
2	81	1140	572	1
3	81	1716	576	0

Функциональность

1. Автоматическая разметка ковидных аномалий по информации о R-R интервалах ЭКГ
2. Автоматическая фильтрация с помощью постпроцессинга
3. Визуализация и инструмент для сравнения полученной и целевой разметки

Особенность проекта

1. Скорость инференса
2. Простота интерпретируемости
3. Анализ и коррекция ошибок

Основной стек технологий:

1. Python3
2. Pandas + NumPy
3. CatBoost

Установка

Требуемые зависимости для тестирования решения:

1. Anaconda + Python 3.8
2. Jupyter notebook

Пакеты python

1. numpy
2. pandas
3. sklearn
4. catboost
5. tqdm

Разработчики

Капралова Анастасия Технический директор GorkyAI

Вадим Альперович Ведущий инженер-исследователь GorkyAI

Кривоносов Михаил М.н.с. кафедры нейротехнологий ИББМ ННГУ им. Н.И.Лобачевского